80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2754 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2754  HEAT domain containing protein  100 
 
 
273 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.202465  normal  0.0148799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.47 
 
 
1148 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.35 
 
 
1343 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.03 
 
 
1094 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.76 
 
 
1181 aa  61.6  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.29 
 
 
1224 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1763  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  26.94 
 
 
1475 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.923912 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.62 
 
 
157 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  33.53 
 
 
1328 aa  56.6  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.5 
 
 
831 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.14 
 
 
302 aa  53.9  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.3 
 
 
192 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.64 
 
 
1234 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.14 
 
 
331 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  27.27 
 
 
644 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.21 
 
 
224 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.58 
 
 
234 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  33.04 
 
 
319 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.7 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2325  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.43 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  32.32 
 
 
323 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.7 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.17 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  26.42 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.35 
 
 
958 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  25.21 
 
 
1141 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.96 
 
 
221 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 
220 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.02 
 
 
1041 aa  47  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1340  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.68 
 
 
278 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.29 
 
 
546 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.36 
 
 
510 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.16 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.68 
 
 
395 aa  46.2  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  31.82 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  29.17 
 
 
886 aa  46.2  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.17 
 
 
234 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 
214 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  38.83 
 
 
1133 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.5 
 
 
157 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.74 
 
 
408 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32 
 
 
223 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  31.25 
 
 
773 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0990  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.39 
 
 
425 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.07 
 
 
323 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.91 
 
 
232 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  32.26 
 
 
838 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.31 
 
 
399 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03361  hypothetical protein  30.2 
 
 
441 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.96766  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  25.77 
 
 
593 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.93 
 
 
1438 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  36.54 
 
 
361 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.25 
 
 
959 aa  43.5  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.74 
 
 
223 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2402  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.14 
 
 
466 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03400  hypothetical protein  26.79 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.46 
 
 
501 aa  43.5  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03449  lyase containing HEAT-repeat protein  26.79 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0119  hypothetical protein  26.79 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537709  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3801  hypothetical protein  26.79 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.334713  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4093  hypothetical protein  26.79 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.403829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0114  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.79 
 
 
280 aa  43.5  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
642 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.48 
 
 
493 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.19 
 
 
642 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.22 
 
 
835 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  32.98 
 
 
321 aa  42.7  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  31.52 
 
 
1194 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.81 
 
 
1139 aa  42.7  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0546  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9308099999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0457  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00117546  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0545  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00111549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0514  iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0600  iron-sulfur cluster-binding protein, putative  33.33 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0245724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0453  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0621  putative iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 
380 aa  42.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  28.27 
 
 
643 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.71 
 
 
226 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>