106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1888 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  75.69 
 
 
218 aa  329  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  55.96 
 
 
220 aa  248  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  60.37 
 
 
220 aa  240  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  57.82 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  53.88 
 
 
220 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  53.88 
 
 
220 aa  219  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.96 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.25 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.76 
 
 
234 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.55 
 
 
212 aa  102  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36 
 
 
223 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.76 
 
 
220 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.17 
 
 
226 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.76 
 
 
220 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.53 
 
 
1181 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.08 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 
1343 aa  70.1  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.54 
 
 
642 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.75 
 
 
641 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.93 
 
 
510 aa  68.9  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2382  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.86 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.509121  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.64 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  32.76 
 
 
643 aa  65.5  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2325  HEAT repeat-containing PBS lyase  31 
 
 
255 aa  65.1  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.52 
 
 
642 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.19 
 
 
958 aa  60.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.43 
 
 
644 aa  60.5  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  27.5 
 
 
493 aa  59.3  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.04 
 
 
1094 aa  58.9  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.47 
 
 
173 aa  58.5  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.84 
 
 
959 aa  57.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.74 
 
 
1148 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  30.43 
 
 
431 aa  56.6  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  32.74 
 
 
320 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.78 
 
 
399 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.42 
 
 
323 aa  52.8  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 
667 aa  52.4  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  25.87 
 
 
593 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  31 
 
 
666 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.21 
 
 
1139 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.37 
 
 
395 aa  52  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  25 
 
 
121 aa  50.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.56 
 
 
670 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5727  heat domain-containing protein  26.04 
 
 
218 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0437  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.71 
 
 
489 aa  49.7  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000498384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  33.61 
 
 
1133 aa  49.3  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.09 
 
 
408 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  27.18 
 
 
381 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3035  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.29 
 
 
222 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.98 
 
 
375 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.7 
 
 
546 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.51 
 
 
822 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  31.75 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.52 
 
 
490 aa  47  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  32.41 
 
 
124 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.34 
 
 
321 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.54 
 
 
331 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.71 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  37.8 
 
 
515 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.11 
 
 
1438 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.8 
 
 
515 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.04 
 
 
377 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  23.08 
 
 
1224 aa  46.2  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0684  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.71 
 
 
1275 aa  45.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  33.01 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.95 
 
 
199 aa  45.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.8 
 
 
515 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.15 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.35 
 
 
206 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.07 
 
 
501 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
157 aa  44.7  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  48.89 
 
 
101 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.808601  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  32.09 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.78 
 
 
320 aa  44.3  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.49 
 
 
121 aa  44.3  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  28.89 
 
 
316 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.59 
 
 
668 aa  43.9  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.68 
 
 
646 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5731  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.58 
 
 
431 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  26.7 
 
 
1194 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.62 
 
 
411 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.08 
 
 
321 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.58 
 
 
369 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  26.22 
 
 
375 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  26.22 
 
 
375 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  28.74 
 
 
646 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.88 
 
 
325 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.61 
 
 
375 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
180 aa  42.4  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.65 
 
 
524 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.87 
 
 
425 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0839106  normal  0.594133 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  26.83 
 
 
375 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_002936  DET0524  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.89 
 
 
316 aa  42  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.25489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.61 
 
 
375 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  25.61 
 
 
375 aa  42  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  25.61 
 
 
375 aa  42  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.61 
 
 
375 aa  42  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.87 
 
 
200 aa  42  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>