183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2690 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.06 
 
 		 666 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.67 
 
 		 510 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.86 
 
 		 667 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  37.37 
 
 		 1148 aa  104  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.18 
 
 		 670 aa  99  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  37.63 
 
 		 1094 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.74 
 
 		 1343 aa  97.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.4 
 
 		 646 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  35.1 
 
 		 646 aa  89.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  36.2 
 
 		 493 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  35.58 
 
 		 958 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.57 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.58 
 
 		 644 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.18 
 
 		 642 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  31.86 
 
 		 431 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.75 
 
 		 668 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.84 
 
 		 1181 aa  77.8  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.43 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  31.61 
 
 		 643 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.09 
 
 		 323 aa  75.5  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1224 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  32.43 
 
 		 1328 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.18 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  34.12 
 
 		 959 aa  74.3  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.5 
 
 		 641 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.82 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.68 
 
 		 1438 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.09 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  35.76 
 
 		 501 aa  73.2  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.31 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.56 
 
 		 522 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  34.12 
 
 		 886 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  36 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.7 
 
 		 831 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.51 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.51 
 
 		 492 aa  67.8  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.48 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.45 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  30.86 
 
 		 517 aa  65.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.42 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.47 
 
 		 1139 aa  65.5  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  30.98 
 
 		 1216 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  35.82 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.05 
 
 		 534 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.42 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  30.05 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.02 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.48 
 
 		 522 aa  62.4  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.89 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.6 
 
 		 546 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.19 
 
 		 390 aa  59.3  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2732  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.94 
 
 		 690 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378578  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.57 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.83 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.94 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 		 524 aa  58.5  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  29.32 
 
 		 395 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.43 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.96 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.12 
 
 		 1110 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.16 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.33 
 
 		 1412 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3485  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  31.93 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  31.25 
 
 		 1143 aa  58.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 		 395 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  28.8 
 
 		 541 aa  57  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.21 
 
 		 121 aa  57  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2916  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.57 
 
 		 690 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0883054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  36.84 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  30.43 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2824  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.57 
 
 		 690 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126862  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  44.16 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  35.57 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  33.55 
 
 		 320 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.52 
 
 		 370 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.93 
 
 		 377 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  27.75 
 
 		 450 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.68 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 		 547 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  29.68 
 
 		 381 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.48 
 
 		 445 aa  53.9  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  31.87 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.61 
 
 		 331 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.43 
 
 		 557 aa  53.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  31.85 
 
 		 1141 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  35.2 
 
 		 1133 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5047  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.26 
 
 		 289 aa  53.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 		 321 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.16 
 
 		 221 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.23 
 
 		 515 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.41 
 
 		 157 aa  52.4  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 284 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  37.23 
 
 		 515 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.04 
 
 		 375 aa  52  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>