30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0423 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 534 aa  1060    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.69 
 
 		 547 aa  299  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.55 
 
 		 545 aa  295  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.65 
 
 		 522 aa  249  8e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.15 
 
 		 522 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.32 
 
 		 557 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  27.98 
 
 		 541 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2816  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.33 
 
 		 720 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2040  PBS lyase heat-like repeat protein  26.96 
 
 		 742 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.71 
 
 		 1343 aa  70.9  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1178  PBS HEAT-like repeat-containing protein  25.37 
 
 		 719 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0250  hypothetical protein  23.96 
 
 		 559 aa  65.1  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538919  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0234  hypothetical protein  23.96 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.05 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  26.09 
 
 		 1148 aa  63.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0698  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.48 
 
 		 753 aa  60.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  23.51 
 
 		 958 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.66 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.64 
 
 		 670 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1094 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  24.03 
 
 		 546 aa  50.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.58 
 
 		 395 aa  50.4  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  28.24 
 
 		 646 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.3 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.34 
 
 		 666 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.82 
 
 		 646 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.29 
 
 		 667 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.27 
 
 		 325 aa  44.3  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.75 
 
 		 234 aa  43.5  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>