72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0131 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 547 aa  1097    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.89 
 
 		 522 aa  419  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  45.32 
 
 		 522 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.53 
 
 		 545 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.01 
 
 		 557 aa  335  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.69 
 
 		 534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  31.12 
 
 		 541 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.46 
 
 		 1343 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  31.18 
 
 		 644 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.37 
 
 		 1148 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2816  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.02 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2040  PBS lyase heat-like repeat protein  24.5 
 
 		 742 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1178  PBS HEAT-like repeat-containing protein  24.9 
 
 		 719 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0250  hypothetical protein  25.82 
 
 		 559 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538919  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1094 aa  70.5  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.16 
 
 		 1438 aa  69.7  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0234  hypothetical protein  24.32 
 
 		 564 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.43 
 
 		 395 aa  67  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.6 
 
 		 510 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.39 
 
 		 1181 aa  66.2  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.5 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.24 
 
 		 958 aa  63.9  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  32.16 
 
 		 593 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.91 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.94 
 
 		 493 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.64 
 
 		 232 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0698  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.65 
 
 		 753 aa  58.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.72 
 
 		 1328 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.78 
 
 		 1216 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.84 
 
 		 208 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1224 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.53 
 
 		 667 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.71 
 
 		 313 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 336 aa  52  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.16 
 
 		 490 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.41 
 
 		 886 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.29 
 
 		 370 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.54 
 
 		 959 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  32.12 
 
 		 522 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.12 
 
 		 219 aa  50.8  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  30 
 
 		 666 aa  50.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.9 
 
 		 524 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.04 
 
 		 399 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.77 
 
 		 1139 aa  48.5  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.62 
 
 		 501 aa  48.5  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.89 
 
 		 408 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 		 515 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 220 aa  47.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  26.9 
 
 		 517 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1340  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.25 
 
 		 278 aa  47.4  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 		 515 aa  47.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.08 
 
 		 302 aa  47.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0719  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.69 
 
 		 423 aa  47.4  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  31.16 
 
 		 515 aa  47  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  32.54 
 
 		 1133 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.13 
 
 		 178 aa  45.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 220 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 220 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.86 
 
 		 192 aa  45.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.09 
 
 		 285 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.12 
 
 		 320 aa  45.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.05 
 
 		 400 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  33.33 
 
 		 320 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.36 
 
 		 220 aa  44.3  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  29.44 
 
 		 431 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.6 
 
 		 390 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.78 
 
 		 212 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.25 
 
 		 321 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5858  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.48 
 
 		 614 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.82 
 
 		 298 aa  43.9  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.23 
 
 		 157 aa  43.9  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.01 
 
 		 1412 aa  43.9  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>