41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5858 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5858  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 614 aa  1233    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1094 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.4 
 
 		 220 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.4 
 
 		 220 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  27.72 
 
 		 546 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.33 
 
 		 323 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.6 
 
 		 223 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.89 
 
 		 667 aa  52.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.94 
 
 		 321 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.06 
 
 		 510 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.83 
 
 		 331 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.06 
 
 		 220 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.95 
 
 		 666 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.25 
 
 		 517 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.97 
 
 		 958 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.6 
 
 		 1139 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 234 aa  50.1  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.41 
 
 		 1181 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.21 
 
 		 395 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 333 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.09 
 
 		 646 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.6 
 
 		 212 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  28.05 
 
 		 320 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.88 
 
 		 223 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  34.33 
 
 		 331 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.33 
 
 		 331 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.58 
 
 		 331 aa  47.4  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 218 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.58 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.78 
 
 		 1343 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.14 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.23 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.08 
 
 		 1224 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.46 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.19 
 
 		 524 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.17 
 
 		 331 aa  45.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.46 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  35.14 
 
 		 1133 aa  44.3  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.1 
 
 		 176 aa  43.9  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  26.99 
 
 		 1216 aa  43.9  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  31.2 
 
 		 493 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>