59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3966 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3966  LigA  100 
 
 
515 aa  959    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  95.77 
 
 
515 aa  752    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  96.18 
 
 
515 aa  757    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0454  HEAT repeat-containing PBS lyase  72.11 
 
 
513 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.954514  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  29.6 
 
 
1148 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.49 
 
 
1343 aa  81.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  27.71 
 
 
644 aa  77  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.46 
 
 
493 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.33 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.69 
 
 
958 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.33 
 
 
221 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.55 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.56 
 
 
510 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.09 
 
 
1094 aa  66.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  27.27 
 
 
1224 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  26.8 
 
 
546 aa  64.7  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.9 
 
 
180 aa  64.7  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 
214 aa  63.9  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.52 
 
 
395 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.52 
 
 
1181 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.24 
 
 
1438 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.34 
 
 
223 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  32.59 
 
 
501 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  39.13 
 
 
1143 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  28.48 
 
 
959 aa  53.9  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.71 
 
 
490 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 
1412 aa  53.5  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.23 
 
 
232 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4610  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.11 
 
 
207 aa  52.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  28.87 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
192 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.48 
 
 
399 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  26.83 
 
 
431 aa  50.8  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.33 
 
 
226 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.48 
 
 
670 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  32.86 
 
 
593 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.92 
 
 
390 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.01 
 
 
313 aa  48.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1391  HEAT domain containing protein  29.1 
 
 
219 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.8 
 
 
220 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.81 
 
 
666 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0294  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  38.1 
 
 
261 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.936732  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.1 
 
 
545 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 
522 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5047  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.14 
 
 
289 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3035  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.33 
 
 
222 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.41949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0156  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.93 
 
 
284 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00291683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.8 
 
 
370 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.25 
 
 
320 aa  44.3  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.41 
 
 
1041 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.79 
 
 
176 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4453  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.74 
 
 
326 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.08 
 
 
886 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3615  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.17 
 
 
221 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32 
 
 
178 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.3 
 
 
220 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  32.62 
 
 
541 aa  43.5  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  37.19 
 
 
1141 aa  43.5  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.96 
 
 
234 aa  43.5  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>