112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4092 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 178 aa  339  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  96.18 
 
 		 168 aa  293  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  57.87 
 
 		 215 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0133  HEAT repeat-containing PBS lyase  58.52 
 
 		 197 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000842725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  54.55 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0425  HEAT repeat-containing PBS lyase  51.69 
 
 		 197 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.164611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  39.08 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.76 
 
 		 1148 aa  88.6  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1343 aa  84.3  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.65 
 
 		 1094 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.67 
 
 		 1438 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  27.38 
 
 		 958 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  33.33 
 
 		 1141 aa  61.6  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.07 
 
 		 220 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.65 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.79 
 
 		 395 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.3 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.14 
 
 		 1181 aa  59.7  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.19 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  29.86 
 
 		 1143 aa  58.5  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.57 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2312  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  40.52 
 
 		 286 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.414762  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.58 
 
 		 546 aa  55.5  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.41 
 
 		 490 aa  55.5  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.38 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  29.75 
 
 		 643 aa  54.7  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  29.46 
 
 		 501 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  31.65 
 
 		 493 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1224 aa  53.9  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.63 
 
 		 313 aa  53.9  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  26.97 
 
 		 959 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  31.35 
 
 		 1137 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1636  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.5 
 
 		 296 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.9 
 
 		 524 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2224  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  42.5 
 
 		 286 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192825  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.41 
 
 		 323 aa  52  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.42 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  30.46 
 
 		 886 aa  52  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.26 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  28.57 
 
 		 395 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 395 aa  51.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.16 
 
 		 642 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.41 
 
 		 670 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.35 
 
 		 303 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 336 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 641 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.02 
 
 		 320 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.77 
 
 		 1328 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  32.17 
 
 		 319 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.92 
 
 		 377 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.24 
 
 		 370 aa  48.5  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.13 
 
 		 831 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.52 
 
 		 666 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  28.05 
 
 		 838 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.95 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.85 
 
 		 399 aa  48.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.92 
 
 		 321 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.86 
 
 		 223 aa  47.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.83 
 
 		 234 aa  47.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  31.25 
 
 		 320 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.55 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  29.57 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 388 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  29.78 
 
 		 321 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.7 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 492 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.48 
 
 		 667 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.79 
 
 		 331 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  26.79 
 
 		 331 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  24.76 
 
 		 644 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  30.26 
 
 		 1216 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1417  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.38 
 
 		 309 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.970236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  22.29 
 
 		 593 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  30.97 
 
 		 325 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.59 
 
 		 1412 aa  44.7  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.32 
 
 		 325 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  32 
 
 		 515 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  31.47 
 
 		 316 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.43 
 
 		 515 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 408 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  27.54 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.25 
 
 		 517 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2426  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.85 
 
 		 464 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  27.32 
 
 		 428 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.07 
 
 		 1139 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0278  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.03 
 
 		 846 aa  43.5  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00401975  hitchhiker  0.000238179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.89 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1507  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.82 
 
 		 445 aa  43.5  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  37 
 
 		 299 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  30.52 
 
 		 1194 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.89 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.68 
 
 		 121 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3973  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.32 
 
 		 309 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.213011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 354 aa  42.4  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.03 
 
 		 226 aa  42  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.84 
 
 		 331 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30 
 
 		 773 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.04 
 
 		 668 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.97 
 
 		 251 aa  42.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>