60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4094 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4094  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 522 aa  1045    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3999  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  92.72 
 
 		 522 aa  952    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00751292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0131  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.34 
 
 		 547 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000220266  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0286  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.01 
 
 		 545 aa  264  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3276  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.38 
 
 		 557 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0257764  normal  0.485312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0423  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.27 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0642387  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  28.07 
 
 		 541 aa  172  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2816  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.83 
 
 		 720 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.67 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.64 
 
 		 644 aa  72  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.44 
 
 		 1148 aa  72  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.3 
 
 		 1343 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1178  PBS HEAT-like repeat-containing protein  25.77 
 
 		 719 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1094 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  26.62 
 
 		 958 aa  69.3  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.32 
 
 		 493 aa  67  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0250  hypothetical protein  26.57 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0538919  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2040  PBS lyase heat-like repeat protein  25.79 
 
 		 742 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.96 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  30.59 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0234  hypothetical protein  26.17 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0698  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.5 
 
 		 753 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27 
 
 		 1328 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.12 
 
 		 546 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.87 
 
 		 1139 aa  54.3  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.8 
 
 		 1438 aa  53.9  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1181 aa  53.9  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4537  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.98 
 
 		 400 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.72 
 
 		 323 aa  52  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.38 
 
 		 313 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.06 
 
 		 510 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.29 
 
 		 670 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.05 
 
 		 1216 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1224 aa  50.4  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.88 
 
 		 395 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  31.88 
 
 		 395 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.03 
 
 		 192 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  27.52 
 
 		 959 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  28.69 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.61 
 
 		 490 aa  47.4  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.6 
 
 		 524 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  31.78 
 
 		 319 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0029  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.89 
 
 		 264 aa  47  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158294  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.63 
 
 		 1412 aa  47  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.22 
 
 		 226 aa  47  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  26.23 
 
 		 431 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1322  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.488747 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32 
 
 		 668 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.11 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.88 
 
 		 224 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.55 
 
 		 234 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.53 
 
 		 180 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0418  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.51 
 
 		 492 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.092568  normal  0.037069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  31.08 
 
 		 522 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  34.11 
 
 		 515 aa  45.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 336 aa  44.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.26 
 
 		 517 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.09 
 
 		 173 aa  43.9  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.94 
 
 		 220 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>