28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4610 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4610  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 207 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0763  heat repeat-containing PBS lyase  53.65 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.24 
 
 		 182 aa  116  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2052  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.69 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  hitchhiker  0.000244943 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03245  PBS lyase HEAT-like repeat  27.23 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1012  hypothetical protein  33.83 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.74 
 
 		 1148 aa  68.6  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.87 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1094 aa  56.2  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.16 
 
 		 666 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.13 
 
 		 510 aa  55.1  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1848  PBS lyase heat-like repeat  33.51 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.52 
 
 		 641 aa  54.7  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.22 
 
 		 1181 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.16 
 
 		 399 aa  52.8  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.28 
 
 		 1343 aa  52.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  30.97 
 
 		 643 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.22 
 
 		 642 aa  48.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.16 
 
 		 667 aa  46.6  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  29.82 
 
 		 958 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.91 
 
 		 313 aa  43.1  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.02 
 
 		 524 aa  43.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.31 
 
 		 646 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2928  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.67 
 
 		 253 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.71825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.12 
 
 		 1438 aa  42  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  38.18 
 
 		 1194 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  30.77 
 
 		 646 aa  42  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  29.9 
 
 		 644 aa  41.2  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>