133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0779 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  63.48 
 
 
642 aa  766    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  69.87 
 
 
642 aa  863    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
641 aa  1274    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  51.11 
 
 
643 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.5 
 
 
667 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.63 
 
 
1343 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.79 
 
 
670 aa  128  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.58 
 
 
666 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.77 
 
 
646 aa  105  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  28.57 
 
 
646 aa  99.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  30.41 
 
 
1148 aa  97.4  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25.87 
 
 
1094 aa  94.4  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.23 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  24.45 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  28.9 
 
 
958 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  27.16 
 
 
421 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  25.66 
 
 
1224 aa  77.8  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.08 
 
 
223 aa  77  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.88 
 
 
232 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.07 
 
 
510 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  24.18 
 
 
546 aa  72  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 
1181 aa  72.4  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.35 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
320 aa  70.5  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  27.8 
 
 
450 aa  69.7  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.75 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.86 
 
 
1438 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.25 
 
 
1139 aa  68.6  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  32.4 
 
 
199 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.56 
 
 
182 aa  67  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.9 
 
 
331 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.89 
 
 
234 aa  65.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  32.86 
 
 
319 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  32.39 
 
 
319 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  30.46 
 
 
218 aa  64.3  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.89 
 
 
220 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.5 
 
 
313 aa  64.3  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.89 
 
 
220 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  30.8 
 
 
325 aa  63.9  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.6 
 
 
208 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.43 
 
 
493 aa  63.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  27.06 
 
 
357 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.16 
 
 
399 aa  63.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  27.37 
 
 
593 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  34.51 
 
 
428 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.12 
 
 
212 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0275  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.52 
 
 
350 aa  61.6  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  23.57 
 
 
959 aa  60.5  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  30.77 
 
 
316 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.89 
 
 
223 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.71 
 
 
215 aa  59.7  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.58 
 
 
220 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.74 
 
 
668 aa  59.7  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  27.07 
 
 
501 aa  58.9  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.64 
 
 
121 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.07 
 
 
370 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.65 
 
 
192 aa  58.5  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.1 
 
 
857 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.1 
 
 
857 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.76 
 
 
1041 aa  57.8  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.34 
 
 
490 aa  57.4  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.09 
 
 
121 aa  57.4  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.45 
 
 
176 aa  57.4  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.73 
 
 
1328 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.32 
 
 
331 aa  56.6  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.86 
 
 
302 aa  56.2  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.77 
 
 
831 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  23.61 
 
 
838 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  27.8 
 
 
321 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  29.47 
 
 
321 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4610  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.52 
 
 
207 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.23 
 
 
1412 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.77 
 
 
220 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  30.43 
 
 
773 aa  55.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.77 
 
 
220 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.5 
 
 
206 aa  54.3  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  32.56 
 
 
323 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.51 
 
 
219 aa  53.9  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  30.46 
 
 
1133 aa  53.9  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.19 
 
 
395 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.87 
 
 
200 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.91 
 
 
331 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.82 
 
 
323 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 
220 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.29 
 
 
180 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  40.86 
 
 
316 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  27.18 
 
 
320 aa  52  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 
173 aa  52.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.18 
 
 
251 aa  52  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.21 
 
 
221 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.71 
 
 
220 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.28 
 
 
325 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.87 
 
 
951 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.52 
 
 
224 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  25.74 
 
 
517 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.2 
 
 
866 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.89 
 
 
320 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2934  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.64 
 
 
276 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0500  heat domain-containing protein  38.71 
 
 
316 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.332473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.18 
 
 
214 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>