14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0763 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0763  heat repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 201 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2052  HEAT repeat-containing PBS lyase  69.5 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  hitchhiker  0.000244943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4610  HEAT repeat-containing PBS lyase  53.65 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.37 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1012  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03245  PBS lyase HEAT-like repeat  28.32 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1848  PBS lyase heat-like repeat  43.97 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  41.3 
 
 		 354 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.18 
 
 		 667 aa  44.7  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.86 
 
 		 666 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  33.33 
 
 		 1343 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 		 642 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5286  hypothetical protein  35.11 
 
 		 389 aa  42  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.692532  normal  0.161018 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  41.6  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>