34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2324 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 182 aa  357  5e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4610  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.38 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03245  PBS lyase HEAT-like repeat  34.25 
 
 		 213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0763  heat repeat-containing PBS lyase  42.37 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1012  hypothetical protein  33.73 
 
 		 218 aa  95.9  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1848  PBS lyase heat-like repeat  40 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2052  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.71 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  hitchhiker  0.000244943 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 		 641 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.17 
 
 		 666 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  30.92 
 
 		 643 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 		 642 aa  58.5  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  39.36 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.84 
 
 		 642 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.91 
 
 		 646 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  31.65 
 
 		 646 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.23 
 
 		 667 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.13 
 
 		 1343 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.48 
 
 		 302 aa  51.2  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.79 
 
 		 670 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.93 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.81 
 
 		 1139 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.1 
 
 		 170 aa  45.1  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  36.14 
 
 		 886 aa  43.9  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.76 
 
 		 395 aa  43.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  32.85 
 
 		 958 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  31.76 
 
 		 501 aa  42.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4212  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.61 
 
 		 1234 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  37.5 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.92 
 
 		 493 aa  42  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.65 
 
 		 492 aa  41.6  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1566  HEAT domain containing protein  32 
 
 		 2243 aa  41.6  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.832677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  33.06 
 
 		 1194 aa  41.6  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.08 
 
 		 668 aa  41.2  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1181 aa  40.8  0.01  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>