116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1151 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  60.19 
 
 
642 aa  719    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 
642 aa  1263    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  69.87 
 
 
641 aa  863    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  48.47 
 
 
643 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.98 
 
 
1343 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.19 
 
 
666 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.64 
 
 
667 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.85 
 
 
670 aa  111  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.09 
 
 
1148 aa  100  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.24 
 
 
958 aa  94.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  25.27 
 
 
1094 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.4 
 
 
492 aa  89  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  27.26 
 
 
646 aa  89  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  26 
 
 
1224 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.91 
 
 
646 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.1 
 
 
1438 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.93 
 
 
510 aa  75.5  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.56 
 
 
232 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.63 
 
 
223 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  25.09 
 
 
546 aa  71.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.84 
 
 
1181 aa  71.2  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  23.73 
 
 
838 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.54 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.06 
 
 
644 aa  67.8  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  26.07 
 
 
493 aa  65.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.96 
 
 
668 aa  66.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  27.05 
 
 
421 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  23.42 
 
 
959 aa  65.1  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  27.31 
 
 
593 aa  65.1  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  25.59 
 
 
1328 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.03 
 
 
320 aa  64.3  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.81 
 
 
234 aa  63.9  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.28 
 
 
200 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.54 
 
 
399 aa  63.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  23.53 
 
 
1133 aa  62.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.94 
 
 
212 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.3 
 
 
313 aa  61.6  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.37 
 
 
208 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  33.12 
 
 
357 aa  61.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.72 
 
 
220 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31 
 
 
321 aa  60.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  29.29 
 
 
218 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.44 
 
 
1139 aa  60.1  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0973  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.59 
 
 
857 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0022485  normal  0.0798851 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0946  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  36.59 
 
 
857 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30 
 
 
501 aa  59.3  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.03 
 
 
226 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.18 
 
 
831 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 
182 aa  58.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  29.41 
 
 
320 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 
220 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.73 
 
 
220 aa  57.4  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0275  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.55 
 
 
350 aa  56.6  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4610  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.87 
 
 
207 aa  57  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2239  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.61 
 
 
220 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.82 
 
 
223 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  26.45 
 
 
321 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  35.51 
 
 
428 aa  55.5  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.76 
 
 
395 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.84 
 
 
220 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.41 
 
 
1412 aa  54.7  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.07 
 
 
180 aa  54.3  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.84 
 
 
192 aa  53.9  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.81 
 
 
220 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.81 
 
 
220 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.12 
 
 
219 aa  53.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.17 
 
 
821 aa  53.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0295  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.22 
 
 
866 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.217847  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.94 
 
 
302 aa  52.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.8 
 
 
524 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4277  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  35.71 
 
 
860 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0756  HEAT repeat-containing protein  30.77 
 
 
541 aa  52.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000382478  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.26 
 
 
1216 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 
224 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  29.82 
 
 
199 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.09 
 
 
323 aa  51.2  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0666  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.76 
 
 
824 aa  50.4  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.16 
 
 
178 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.65 
 
 
206 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.05 
 
 
325 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.26 
 
 
370 aa  49.7  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1012  hypothetical protein  28.26 
 
 
218 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.56 
 
 
221 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.65 
 
 
162 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.63 
 
 
121 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.58 
 
 
886 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.82 
 
 
176 aa  48.5  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3784  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  26.13 
 
 
858 aa  48.5  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.76 
 
 
215 aa  47.8  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.81 
 
 
214 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1566  HEAT domain containing protein  29.21 
 
 
2243 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.832677 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.11 
 
 
490 aa  47.4  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  29.65 
 
 
431 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 
173 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.4 
 
 
823 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_465  PBS lyase heat-like repeat domain protein  39.78 
 
 
316 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.089505  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.37 
 
 
251 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  28.12 
 
 
395 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.13 
 
 
1041 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.96 
 
 
822 aa  46.6  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>