15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03245 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03245  PBS lyase HEAT-like repeat  100 
 
 		 213 aa  440  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.25 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1012  hypothetical protein  35.07 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4610  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.91 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1848  PBS lyase heat-like repeat  29.57 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0763  heat repeat-containing PBS lyase  28.06 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 646 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  34.01 
 
 		 646 aa  52  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2052  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.57 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.469291  hitchhiker  0.000244943 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.5 
 
 		 642 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.33 
 
 		 641 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.32 
 
 		 492 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.48 
 
 		 642 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.61 
 
 		 667 aa  42.4  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.9 
 
 		 302 aa  41.6  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>