135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0761 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  91.49 
 
 		 646 aa  1085    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  100 
 
 		 646 aa  1248    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.75 
 
 		 670 aa  546  1e-154  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.51 
 
 		 666 aa  479  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.51 
 
 		 667 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.6 
 
 		 668 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  28.13 
 
 		 1343 aa  136  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.04 
 
 		 641 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  24.81 
 
 		 958 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1094 aa  115  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.12 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.44 
 
 		 642 aa  109  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.6 
 
 		 1148 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2732  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.93 
 
 		 690 aa  101  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.378578  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.63 
 
 		 493 aa  94.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2824  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.63 
 
 		 690 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126862  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.54 
 
 		 1181 aa  89.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2916  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.63 
 
 		 690 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0883054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.26 
 
 		 232 aa  87.4  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  25.21 
 
 		 643 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.83 
 
 		 642 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.54 
 
 		 1438 aa  84.3  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.19 
 
 		 644 aa  83.6  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  27.2 
 
 		 1328 aa  80.9  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.52 
 
 		 1139 aa  80.9  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  25.56 
 
 		 959 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.04 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.7 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.42 
 
 		 501 aa  73.9  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.03 
 
 		 492 aa  71.2  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1224 aa  70.5  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  24.1 
 
 		 546 aa  70.1  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.3 
 
 		 593 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  25 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  27.35 
 
 		 886 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  27.6 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.92 
 
 		 490 aa  65.9  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.2 
 
 		 1412 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.06 
 
 		 390 aa  65.9  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.45 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  34.31 
 
 		 319 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  25.3 
 
 		 838 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.16 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.46 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  27.44 
 
 		 357 aa  59.3  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.52 
 
 		 200 aa  59.7  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.18 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.32 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.72 
 
 		 208 aa  58.2  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  38.39 
 
 		 199 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4091  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0472779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4203  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  20.62 
 
 		 450 aa  57  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.48 
 
 		 121 aa  56.6  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.35 
 
 		 180 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.37 
 
 		 302 aa  56.6  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.75 
 
 		 323 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 176 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  36 
 
 		 1110 aa  55.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  26.25 
 
 		 517 aa  55.1  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.96 
 
 		 313 aa  55.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.64 
 
 		 408 aa  54.7  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.61 
 
 		 285 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  30.55 
 
 		 319 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  25.96 
 
 		 431 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.65 
 
 		 182 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.64 
 
 		 831 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  22.78 
 
 		 1133 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0469  HEAT domain containing protein  39.44 
 
 		 374 aa  53.9  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.421538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  24.71 
 
 		 381 aa  52.4  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  35.11 
 
 		 323 aa  52  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.78 
 
 		 331 aa  51.6  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03245  PBS lyase HEAT-like repeat  34.01 
 
 		 213 aa  52  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  29.03 
 
 		 773 aa  51.2  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.89 
 
 		 320 aa  50.8  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.29 
 
 		 150 aa  50.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1489  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.37 
 
 		 374 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1518  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.37 
 
 		 374 aa  50.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.08 
 
 		 321 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.25 
 
 		 377 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.04 
 
 		 331 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3571  signal transduction protein  24.68 
 
 		 2194 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  33.04 
 
 		 331 aa  48.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  30.42 
 
 		 321 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.47 
 
 		 1041 aa  48.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2190  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.99 
 
 		 411 aa  47.4  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  28.23 
 
 		 218 aa  47.4  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.07 
 
 		 375 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  33.07 
 
 		 375 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  33.07 
 
 		 375 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  32.41 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.07 
 
 		 375 aa  47  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2463  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.86 
 
 		 224 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.91 
 
 		 320 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.55 
 
 		 220 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0980  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.71 
 
 		 219 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.042458  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  34.9 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  39.68 
 
 		 421 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.9 
 
 		 333 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.59 
 
 		 284 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>