More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1826 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  100 
 
 		 1094 aa  2188    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1224 aa  428  1e-118  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.35 
 
 		 1343 aa  363  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  32.24 
 
 		 1148 aa  321  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.13 
 
 		 510 aa  308  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 		 1438 aa  214  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  36.73 
 
 		 958 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  36.14 
 
 		 644 aa  196  3e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  38.39 
 
 		 501 aa  186  3e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.29 
 
 		 395 aa  184  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  34.04 
 
 		 493 aa  181  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.62 
 
 		 490 aa  179  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  36.55 
 
 		 838 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  31.78 
 
 		 546 aa  170  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.86 
 
 		 399 aa  170  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.89 
 
 		 524 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.1 
 
 		 1412 aa  166  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.1 
 
 		 1181 aa  165  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.9 
 
 		 1139 aa  160  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.31 
 
 		 1328 aa  159  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  55.4 
 
 		 1039 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0996  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.78 
 
 		 1110 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.399368  normal  0.160233 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.96 
 
 		 390 aa  152  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  29.35 
 
 		 959 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.67 
 
 		 323 aa  146  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.2 
 
 		 313 aa  137  9e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.66 
 
 		 670 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  31.76 
 
 		 1133 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  36.72 
 
 		 517 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  32.58 
 
 		 1194 aa  132  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  31.99 
 
 		 319 aa  132  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.92 
 
 		 320 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3349  heat domain-containing protein  32.32 
 
 		 319 aa  127  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.1 
 
 		 331 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  41.18 
 
 		 431 aa  122  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.75 
 
 		 408 aa  121  7.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  30.03 
 
 		 428 aa  120  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.51 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.41 
 
 		 192 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  33.11 
 
 		 321 aa  118  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.11 
 
 		 325 aa  118  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.08 
 
 		 321 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.13 
 
 		 667 aa  118  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 302 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.38 
 
 		 370 aa  118  7.999999999999999e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3674  HEAT domain containing protein  31.89 
 
 		 323 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.631029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  32.04 
 
 		 320 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34930  putative phycobiliprotein  31.15 
 
 		 321 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771282  normal  0.964295 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  35.1 
 
 		 773 aa  112  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  28.81 
 
 		 886 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  34.45 
 
 		 522 aa  110  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4985  signal transduction protein  25.2 
 
 		 1345 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.266997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  30.72 
 
 		 316 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.87 
 
 		 642 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.62 
 
 		 251 aa  107  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.5 
 
 		 333 aa  106  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.12 
 
 		 180 aa  107  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2001  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.42 
 
 		 334 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  36.65 
 
 		 199 aa  106  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  24.02 
 
 		 1349 aa  105  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.53 
 
 		 321 aa  105  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1752  hypothetical protein  36.87 
 
 		 250 aa  103  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.253022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.42 
 
 		 408 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.82 
 
 		 220 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.31 
 
 		 220 aa  102  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6100  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.76 
 
 		 331 aa  101  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1977  heat domain-containing protein  31.76 
 
 		 331 aa  101  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237799  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.32 
 
 		 200 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.48 
 
 		 646 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.66 
 
 		 331 aa  100  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  28.17 
 
 		 361 aa  99.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  31.99 
 
 		 643 aa  99.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0570  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.38 
 
 		 1235 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.466575 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0553  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.48 
 
 		 1235 aa  99  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2632  signal transduction protein  22.9 
 
 		 1742 aa  99.4  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.95 
 
 		 666 aa  97.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  39.41 
 
 		 208 aa  97.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.11 
 
 		 212 aa  97.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  26.21 
 
 		 646 aa  97.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.63 
 
 		 232 aa  96.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.28 
 
 		 331 aa  97.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  37.77 
 
 		 299 aa  96.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  32.09 
 
 		 402 aa  96.3  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4476  signal transduction protein  22.17 
 
 		 1237 aa  96.3  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.62278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.99 
 
 		 176 aa  95.5  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1133  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  21.36 
 
 		 951 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.45 
 
 		 831 aa  94.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2496  signal transduction protein  24.24 
 
 		 1339 aa  94.7  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.87 
 
 		 641 aa  94.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.8 
 
 		 223 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 234 aa  94.4  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  31.1 
 
 		 593 aa  94  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3638  HEAT domain containing protein  28.1 
 
 		 395 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.942525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2470  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.1 
 
 		 395 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  28.23 
 
 		 325 aa  93.2  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.98 
 
 		 285 aa  93.2  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.73 
 
 		 1174 aa  91.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1500  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.12 
 
 		 762 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.76 
 
 		 157 aa  90.5  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1473  putative signal transduction protein with Nacht domain  26.12 
 
 		 762 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>