129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1378 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  100 
 
 
643 aa  1301    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  51.11 
 
 
641 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  50 
 
 
642 aa  569  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1151  HEAT repeat-containing PBS lyase  48.72 
 
 
642 aa  561  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.61 
 
 
670 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.05 
 
 
667 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.24 
 
 
1343 aa  130  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.48 
 
 
666 aa  124  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  27.12 
 
 
646 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.82 
 
 
646 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  31.65 
 
 
1094 aa  98.6  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.53 
 
 
958 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  31.76 
 
 
1148 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0578  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.94 
 
 
492 aa  89  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.94571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.19 
 
 
1181 aa  83.2  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.58 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.78 
 
 
1438 aa  78.2  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.38 
 
 
1224 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.78 
 
 
668 aa  78.2  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0778  HEAT domain containing protein  26.39 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.21 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  26.95 
 
 
644 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1458  hypothetical protein  25.47 
 
 
357 aa  71.2  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.39 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  24.65 
 
 
1133 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.5 
 
 
370 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.71 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  30.3 
 
 
1328 aa  67  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  27.32 
 
 
199 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.87 
 
 
399 aa  65.1  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0241  diguanylate cyclase  26.84 
 
 
450 aa  65.1  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1480  HEAT repeat-containing protein  27.83 
 
 
325 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.19 
 
 
831 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  34.29 
 
 
501 aa  63.5  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.21 
 
 
121 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.8 
 
 
395 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  24.52 
 
 
493 aa  61.6  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.19 
 
 
223 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 
593 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.69 
 
 
200 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.65 
 
 
192 aa  61.2  0.00000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4198  HEAT domain containing protein  26.57 
 
 
321 aa  61.6  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.12 
 
 
546 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  22.57 
 
 
959 aa  61.2  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.92 
 
 
206 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2324  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.92 
 
 
182 aa  60.1  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.07 
 
 
524 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  32 
 
 
218 aa  60.1  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  32.52 
 
 
838 aa  58.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.35 
 
 
220 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.97 
 
 
180 aa  57.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.22 
 
 
220 aa  57.4  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1875  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.22 
 
 
302 aa  57.4  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.07 
 
 
390 aa  57.4  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.22 
 
 
220 aa  57  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2859  HEAT domain containing protein  28.64 
 
 
428 aa  57  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.335978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.53 
 
 
220 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.55 
 
 
226 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.54 
 
 
320 aa  56.2  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  28.5 
 
 
320 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.89 
 
 
176 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.82 
 
 
331 aa  55.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3274  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.55 
 
 
215 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000494855  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.55 
 
 
223 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.97 
 
 
212 aa  55.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.92 
 
 
178 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.04 
 
 
234 aa  54.3  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3676  HEAT domain containing protein  32.74 
 
 
886 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000145397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.74 
 
 
219 aa  54.3  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  28.92 
 
 
431 aa  53.9  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  29.66 
 
 
321 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.86 
 
 
408 aa  53.9  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.67 
 
 
490 aa  53.5  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.17 
 
 
1139 aa  53.5  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1940  SH3 type 3 domain-containing protein  31.5 
 
 
522 aa  53.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2742  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.3 
 
 
121 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.89 
 
 
313 aa  53.1  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1642  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.84 
 
 
821 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.723052  normal  0.546905 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 
157 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.88 
 
 
173 aa  52  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6151  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.8 
 
 
321 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4882  hypothetical protein  28.9 
 
 
316 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453587  normal  0.143497 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  33.05 
 
 
402 aa  52  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0275  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.61 
 
 
350 aa  51.6  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381814  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2127  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.39 
 
 
823 aa  51.6  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.17 
 
 
251 aa  51.2  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0609  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.24 
 
 
822 aa  50.8  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1293  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.35 
 
 
333 aa  50.8  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.737747  normal  0.270405 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.16 
 
 
168 aa  50.8  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.5 
 
 
325 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.59 
 
 
331 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.31 
 
 
331 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0940  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.71 
 
 
408 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0319  response regulator receiver protein  28.29 
 
 
538 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  36.63 
 
 
124 aa  49.7  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.37 
 
 
1412 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  29.57 
 
 
1194 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3977  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.09 
 
 
567 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.110914  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  26.63 
 
 
361 aa  48.9  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.94 
 
 
321 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>