126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4620 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  54.31 
 
 		 1141 aa  1249    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  100 
 
 		 1143 aa  2342    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  51.23 
 
 		 1137 aa  1170    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  35.05 
 
 		 1110 aa  627  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  22.12 
 
 		 1058 aa  132  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.98 
 
 		 968 aa  125  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.45 
 
 		 1181 aa  123  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.65 
 
 		 1162 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.49 
 
 		 1040 aa  122  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.18 
 
 		 1027 aa  117  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.74 
 
 		 1023 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  25.4 
 
 		 1439 aa  110  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.52 
 
 		 1286 aa  109  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  26.3 
 
 		 1343 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.54 
 
 		 1201 aa  106  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.68 
 
 		 864 aa  94.4  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.89 
 
 		 868 aa  94.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  24.9 
 
 		 880 aa  90.9  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1094 aa  83.2  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.55 
 
 		 1274 aa  84  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.87 
 
 		 1149 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  27.02 
 
 		 1148 aa  80.1  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.3 
 
 		 1193 aa  80.1  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.69 
 
 		 1503 aa  79.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  22.83 
 
 		 1142 aa  78.6  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  29.86 
 
 		 902 aa  77.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  26.14 
 
 		 874 aa  77  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  32.3 
 
 		 924 aa  71.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  27.27 
 
 		 898 aa  70.1  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  24.66 
 
 		 1133 aa  69.3  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.81 
 
 		 1084 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.4 
 
 		 1171 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.2 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 		 1139 aa  64.3  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.06 
 
 		 1390 aa  63.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.2 
 
 		 958 aa  63.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.83 
 
 		 491 aa  62.4  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  25.73 
 
 		 501 aa  61.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  26.81 
 
 		 460 aa  61.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  26.39 
 
 		 1139 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  27.42 
 
 		 1077 aa  59.7  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  28.01 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.66 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.66 
 
 		 168 aa  59.3  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.62 
 
 		 1180 aa  59.3  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.97 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 		 232 aa  58.9  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.51 
 
 		 371 aa  58.5  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.48 
 
 		 524 aa  58.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  26.36 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1224 aa  58.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.95 
 
 		 1265 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.6 
 
 		 510 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  24.24 
 
 		 418 aa  57.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  25.65 
 
 		 493 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  29.65 
 
 		 381 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.85 
 
 		 178 aa  56.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.93 
 
 		 705 aa  56.6  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  21.8 
 
 		 1328 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  26.48 
 
 		 439 aa  56.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.11 
 
 		 666 aa  55.5  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.49 
 
 		 176 aa  55.5  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0454  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.09 
 
 		 513 aa  55.1  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.954514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  23.19 
 
 		 756 aa  54.7  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24 
 
 		 1181 aa  54.7  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.01 
 
 		 323 aa  53.9  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  23.72 
 
 		 363 aa  53.5  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.88 
 
 		 1306 aa  53.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.25 
 
 		 371 aa  53.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  24.47 
 
 		 617 aa  53.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.33 
 
 		 379 aa  53.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4110  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.47 
 
 		 515 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0298438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3966  LigA  38.82 
 
 		 515 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0113076  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.36 
 
 		 370 aa  51.6  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.5 
 
 		 670 aa  51.6  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.78 
 
 		 667 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  23.66 
 
 		 502 aa  51.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.3 
 
 		 121 aa  50.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  27.5 
 
 		 379 aa  50.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.67 
 
 		 313 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  25.47 
 
 		 423 aa  50.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.66 
 
 		 180 aa  50.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.67 
 
 		 157 aa  50.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  26.42 
 
 		 438 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.08 
 
 		 379 aa  49.7  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  28.9 
 
 		 644 aa  49.3  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  32.35 
 
 		 585 aa  49.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1010 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  31.48 
 
 		 517 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  27.27 
 
 		 431 aa  48.9  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.92 
 
 		 379 aa  48.9  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4077  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.29 
 
 		 515 aa  48.9  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.09 
 
 		 642 aa  48.9  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  27.5 
 
 		 379 aa  48.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  25.3 
 
 		 408 aa  48.5  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0288  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.59 
 
 		 206 aa  47.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1636  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.06 
 
 		 296 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.96 
 
 		 192 aa  47.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  23.94 
 
 		 438 aa  47.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  25.34 
 
 		 422 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>