283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4182 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  90.41 
 
 
379 aa  644    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  88.68 
 
 
379 aa  674    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  100 
 
 
379 aa  765    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  92.35 
 
 
379 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  91.03 
 
 
379 aa  681    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  88.13 
 
 
379 aa  672    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  91.03 
 
 
379 aa  681    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  77.55 
 
 
355 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  74.05 
 
 
372 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  75.56 
 
 
389 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  76.68 
 
 
419 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  71.09 
 
 
394 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  66.84 
 
 
394 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  67.8 
 
 
357 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  65.72 
 
 
357 aa  474  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  62.19 
 
 
391 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  75.09 
 
 
299 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  75.09 
 
 
316 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  63.37 
 
 
377 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  60.64 
 
 
436 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  59.5 
 
 
362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56.76 
 
 
371 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  59.71 
 
 
379 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  52.63 
 
 
381 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  52.77 
 
 
384 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  51.8 
 
 
363 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  51.8 
 
 
363 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  52.76 
 
 
361 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  50.13 
 
 
371 aa  378  1e-104  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56.18 
 
 
466 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  57.85 
 
 
376 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  49.86 
 
 
367 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  48.48 
 
 
371 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  51.1 
 
 
424 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  46.09 
 
 
369 aa  336  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  46.26 
 
 
361 aa  335  5e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  50.29 
 
 
349 aa  333  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  45.28 
 
 
369 aa  328  9e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.37 
 
 
380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  46.63 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  46.04 
 
 
417 aa  319  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  48.27 
 
 
380 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  48.51 
 
 
642 aa  315  7e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  45.27 
 
 
425 aa  308  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  39.01 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.52 
 
 
388 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.24 
 
 
380 aa  260  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.07 
 
 
391 aa  258  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.23 
 
 
391 aa  256  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.5 
 
 
390 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.5 
 
 
390 aa  255  7e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  43.01 
 
 
419 aa  255  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.23 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  40.41 
 
 
418 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.82 
 
 
391 aa  252  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.12 
 
 
391 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.12 
 
 
391 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.95 
 
 
390 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.83 
 
 
373 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.54 
 
 
387 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.93 
 
 
386 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.74 
 
 
418 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  40.53 
 
 
396 aa  247  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.35 
 
 
391 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  42.22 
 
 
420 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  42.74 
 
 
428 aa  243  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.17 
 
 
423 aa  243  5e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  42.18 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.78 
 
 
418 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.78 
 
 
418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  38.64 
 
 
460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.06 
 
 
427 aa  229  7e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.56 
 
 
419 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  32.81 
 
 
379 aa  222  7e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  38.9 
 
 
422 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  40.49 
 
 
419 aa  218  2e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  37.46 
 
 
363 aa  216  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  36.27 
 
 
423 aa  216  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  35.57 
 
 
398 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  34.36 
 
 
411 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  37.57 
 
 
617 aa  204  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.92 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.92 
 
 
403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  33.9 
 
 
546 aa  188  1e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.47 
 
 
423 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  35 
 
 
448 aa  179  7e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 
421 aa  175  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.64 
 
 
420 aa  173  5e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.23 
 
 
437 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  37.16 
 
 
439 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  37.29 
 
 
439 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  34.23 
 
 
438 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  36.24 
 
 
446 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  31.33 
 
 
433 aa  163  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  31.93 
 
 
446 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  32.24 
 
 
422 aa  159  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  32.16 
 
 
408 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  31.77 
 
 
439 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  30.08 
 
 
430 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>