59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6252 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  100 
 
 		 874 aa  1801    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  67.8 
 
 		 880 aa  1241    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  37.3 
 
 		 1439 aa  404  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.91 
 
 		 968 aa  141  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.41 
 
 		 1201 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.88 
 
 		 1023 aa  99  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.69 
 
 		 1040 aa  99  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  26.57 
 
 		 1058 aa  91.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  25.35 
 
 		 1141 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  25.42 
 
 		 1110 aa  90.9  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.43 
 
 		 1027 aa  87.8  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.91 
 
 		 1149 aa  86.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  27.17 
 
 		 1142 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  23.64 
 
 		 1137 aa  77.4  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  26.14 
 
 		 1143 aa  77  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.47 
 
 		 1162 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.17 
 
 		 1181 aa  74.7  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  27.56 
 
 		 168 aa  72  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  30.54 
 
 		 1077 aa  71.6  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.98 
 
 		 868 aa  70.5  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.03 
 
 		 1286 aa  70.1  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.66 
 
 		 864 aa  68.2  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.11 
 
 		 1193 aa  67.4  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  30.72 
 
 		 1139 aa  67  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  29.23 
 
 		 902 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  26.83 
 
 		 898 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  26.92 
 
 		 924 aa  60.8  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.16 
 
 		 1503 aa  60.1  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.21 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.73 
 
 		 1265 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.65 
 
 		 1274 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.95 
 
 		 1390 aa  57  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.3 
 
 		 1084 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.67 
 
 		 436 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  24.55 
 
 		 423 aa  52.4  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  24.03 
 
 		 460 aa  52.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  25.99 
 
 		 381 aa  51.6  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.57 
 
 		 438 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  25.15 
 
 		 447 aa  50.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 418 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  25.97 
 
 		 410 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.16 
 
 		 418 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.04 
 
 		 957 aa  48.5  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  23.11 
 
 		 423 aa  48.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30.85 
 
 		 330 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  25.14 
 
 		 363 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  23.91 
 
 		 384 aa  47.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 330 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  26.95 
 
 		 420 aa  47  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.39 
 
 		 487 aa  47  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.23 
 
 		 423 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  25.57 
 
 		 617 aa  45.8  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.76 
 
 		 388 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.93 
 
 		 316 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  24.27 
 
 		 448 aa  44.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  24.12 
 
 		 446 aa  44.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.33 
 
 		 427 aa  44.3  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.33 
 
 		 427 aa  44.3  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.33 
 
 		 427 aa  44.3  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>