45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1153 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 864 aa  1768    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.9 
 
 		 968 aa  149  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.72 
 
 		 1027 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.6 
 
 		 1040 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.08 
 
 		 1201 aa  131  4.0000000000000003e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  26.71 
 
 		 1110 aa  104  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.6 
 
 		 1023 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.55 
 
 		 1084 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.17 
 
 		 1162 aa  95.5  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  30.68 
 
 		 1143 aa  94.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  36.3 
 
 		 1141 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.28 
 
 		 1149 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.1 
 
 		 1181 aa  91.3  8e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  32.86 
 
 		 1137 aa  89  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.77 
 
 		 1503 aa  88.6  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.8 
 
 		 1193 aa  89  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  37.23 
 
 		 924 aa  87.8  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.14 
 
 		 868 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  34.06 
 
 		 1139 aa  82  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  33.33 
 
 		 1058 aa  80.9  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  35.46 
 
 		 1142 aa  80.1  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.3 
 
 		 1306 aa  80.9  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  34.04 
 
 		 1439 aa  79.7  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  33.9 
 
 		 1077 aa  78.2  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.33 
 
 		 1286 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1068 aa  75.1  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  26.57 
 
 		 898 aa  74.7  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  27.23 
 
 		 880 aa  74.7  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  28.17 
 
 		 902 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.37 
 
 		 466 aa  68.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  27.66 
 
 		 874 aa  68.2  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.06 
 
 		 1055 aa  68.2  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  27.94 
 
 		 168 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.32 
 
 		 1390 aa  62.4  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.23 
 
 		 951 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.77 
 
 		 957 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.25 
 
 		 1265 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.38 
 
 		 1274 aa  53.5  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.99 
 
 		 1180 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  24.64 
 
 		 369 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  23.53 
 
 		 920 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  24.64 
 
 		 363 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  23.89 
 
 		 460 aa  45.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  29.17 
 
 		 396 aa  45.1  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.31 
 
 		 491 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>