122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4779 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.89 
 
 		 1181 aa  833    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  66.52 
 
 		 1149 aa  1516    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1162 aa  2372    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  39.36 
 
 		 1306 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.24 
 
 		 1055 aa  365  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.53 
 
 		 1068 aa  351  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  34.87 
 
 		 1139 aa  316  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  33.12 
 
 		 1390 aa  258  3e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.22 
 
 		 1040 aa  248  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.93 
 
 		 1503 aa  221  5e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.63 
 
 		 1201 aa  210  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.14 
 
 		 1171 aa  208  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.17 
 
 		 1274 aa  207  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.96 
 
 		 1180 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.45 
 
 		 1265 aa  199  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.25 
 
 		 1193 aa  197  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  24.86 
 
 		 1110 aa  194  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.96 
 
 		 968 aa  193  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.68 
 
 		 1027 aa  191  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.36 
 
 		 1286 aa  190  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.08 
 
 		 957 aa  187  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.04 
 
 		 868 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.02 
 
 		 1084 aa  179  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.6 
 
 		 951 aa  178  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.39 
 
 		 1023 aa  162  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  26.06 
 
 		 756 aa  154  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  22.65 
 
 		 1143 aa  141  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.04 
 
 		 759 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.8 
 
 		 712 aa  131  8.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.2 
 
 		 852 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.44 
 
 		 762 aa  125  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  22.47 
 
 		 1058 aa  124  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.26 
 
 		 705 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.77 
 
 		 749 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  22.74 
 
 		 1141 aa  110  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  29.55 
 
 		 1439 aa  108  6e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 773 aa  97.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.17 
 
 		 864 aa  95.1  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  21.05 
 
 		 1137 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  30.56 
 
 		 880 aa  80.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.71 
 
 		 436 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  28.47 
 
 		 874 aa  78.6  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.11 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.36 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.98 
 
 		 371 aa  72  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  28.49 
 
 		 924 aa  71.2  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  33.82 
 
 		 902 aa  70.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  30.56 
 
 		 898 aa  67.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  22.29 
 
 		 384 aa  67  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  25.1 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  30.23 
 
 		 168 aa  66.2  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  25.87 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.86 
 
 		 379 aa  63.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  26.28 
 
 		 1142 aa  62.4  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.92 
 
 		 369 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  23.93 
 
 		 502 aa  61.2  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.68 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  24.64 
 
 		 418 aa  60.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  23.94 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.59 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  24.78 
 
 		 514 aa  59.3  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.09 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.2 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.03 
 
 		 403 aa  57  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.03 
 
 		 403 aa  57  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  24.27 
 
 		 363 aa  56.6  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  23.75 
 
 		 430 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  23.75 
 
 		 430 aa  55.5  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.58 
 
 		 361 aa  55.1  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  24.11 
 
 		 642 aa  54.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  26.25 
 
 		 430 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  28.37 
 
 		 447 aa  53.5  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  27.48 
 
 		 439 aa  53.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  27.66 
 
 		 438 aa  53.1  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  24.7 
 
 		 438 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  26.53 
 
 		 448 aa  52.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.35 
 
 		 377 aa  52  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  22.31 
 
 		 546 aa  52  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.26 
 
 		 390 aa  51.6  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.26 
 
 		 390 aa  51.6  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.26 
 
 		 390 aa  51.6  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  21.71 
 
 		 361 aa  51.6  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.26 
 
 		 390 aa  51.6  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  22.06 
 
 		 367 aa  51.2  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  26.71 
 
 		 446 aa  50.8  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.57 
 
 		 391 aa  50.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  23.22 
 
 		 428 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  22.74 
 
 		 422 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  27.54 
 
 		 435 aa  50.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  25.83 
 
 		 1077 aa  50.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26 
 
 		 433 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.03 
 
 		 427 aa  50.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.09 
 
 		 391 aa  49.7  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  25.33 
 
 		 456 aa  49.7  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  25.17 
 
 		 473 aa  49.7  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  25.23 
 
 		 485 aa  49.7  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.39 
 
 		 448 aa  49.7  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  25.17 
 
 		 371 aa  49.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  25.85 
 
 		 448 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  23.82 
 
 		 525 aa  49.3  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>