273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0941 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  100 
 
 		 361 aa  743    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  72.3 
 
 		 367 aa  548  1e-155  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  58.86 
 
 		 379 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  57.89 
 
 		 371 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  54.47 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  54.6 
 
 		 384 aa  402  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  54.32 
 
 		 362 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  55.26 
 
 		 381 aa  391  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  56.69 
 
 		 377 aa  392  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  55.81 
 
 		 391 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54.12 
 
 		 436 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  53.94 
 
 		 357 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  51.94 
 
 		 361 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  52.51 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  53.35 
 
 		 357 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  53.94 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  49.58 
 
 		 363 aa  374  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  53.03 
 
 		 371 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  49.86 
 
 		 369 aa  371  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  52.75 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  52.17 
 
 		 419 aa  369  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  52.75 
 
 		 372 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  55.1 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  54.94 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  49.59 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  53.2 
 
 		 379 aa  370  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  52.75 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.19 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  49.3 
 
 		 363 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.13 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.71 
 
 		 379 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  51.14 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.14 
 
 		 379 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  51.76 
 
 		 379 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  51.03 
 
 		 380 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  50.58 
 
 		 642 aa  342  5e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  51.02 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  50.15 
 
 		 417 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  50.73 
 
 		 425 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  48.75 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  49.13 
 
 		 349 aa  332  8e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  46.34 
 
 		 376 aa  328  7e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  43.61 
 
 		 388 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  45.76 
 
 		 387 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  45.83 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  44.86 
 
 		 373 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  44.19 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  44.97 
 
 		 380 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  43.82 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  43.18 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  43.18 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  43.73 
 
 		 391 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  44.81 
 
 		 391 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  42.9 
 
 		 390 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  42.62 
 
 		 390 aa  306  3e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  44.51 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  44.51 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  42.43 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  49.82 
 
 		 316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  49.82 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  42.94 
 
 		 419 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.04 
 
 		 427 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.83 
 
 		 418 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  38.16 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  38.78 
 
 		 418 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  43.25 
 
 		 428 aa  239  4e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  43.21 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  41.6 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  40.66 
 
 		 419 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  38.48 
 
 		 396 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  39.72 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  38.08 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  36.94 
 
 		 460 aa  233  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  41.21 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  38.74 
 
 		 422 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  36.31 
 
 		 411 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  38.27 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  35.21 
 
 		 410 aa  219  3.9999999999999997e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.5 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.5 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  37.04 
 
 		 379 aa  216  5e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  35.23 
 
 		 617 aa  211  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  32.61 
 
 		 423 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  35.31 
 
 		 448 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  34.7 
 
 		 546 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 437 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  33.81 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  35.37 
 
 		 514 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  33.87 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.81 
 
 		 423 aa  175  8e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  37.22 
 
 		 456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  36.1 
 
 		 448 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.29 
 
 		 420 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  33.75 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  31.78 
 
 		 438 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  35.62 
 
 		 525 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  36.52 
 
 		 439 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  32.01 
 
 		 485 aa  169  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  31.9 
 
 		 421 aa  169  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>