More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3985 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 
852 aa  1753    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.65 
 
 
759 aa  440  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  42.44 
 
 
749 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  45.79 
 
 
762 aa  417  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  40.59 
 
 
773 aa  403  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  35.31 
 
 
756 aa  278  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.71 
 
 
705 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.88 
 
 
712 aa  213  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  31.95 
 
 
1171 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.12 
 
 
1180 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.74 
 
 
1274 aa  162  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.87 
 
 
1265 aa  155  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.11 
 
 
1503 aa  139  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.01 
 
 
1181 aa  133  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.2 
 
 
1162 aa  130  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.51 
 
 
1149 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.52 
 
 
1027 aa  111  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.57 
 
 
1286 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.12 
 
 
1193 aa  107  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.57 
 
 
1068 aa  98.2  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.38 
 
 
1055 aa  94  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  36.36 
 
 
577 aa  92.4  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.59 
 
 
957 aa  92  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.43 
 
 
1040 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02321  hypothetical protein  36.44 
 
 
203 aa  87.8  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0244328  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  31.15 
 
 
587 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3926  cytochrome c family protein  31.61 
 
 
222 aa  85.5  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.426515  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1369  cytochrome c class I  34.96 
 
 
161 aa  85.1  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.77 
 
 
951 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.61 
 
 
601 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.37 
 
 
1023 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2127  cytochrome c class I  36.84 
 
 
202 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169346  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  35.94 
 
 
868 aa  83.2  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2418  nitrite reductase, copper-containing  35.82 
 
 
479 aa  82  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4324  cbb3-type cytochrome c oxidase subunit III  37.5 
 
 
202 aa  81.6  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.753936  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4125  cytochrome c, class I  34.45 
 
 
202 aa  80.5  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3648  cytochrome c class I  37.61 
 
 
147 aa  80.9  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00073069  normal  0.303937 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1432  cytochrome c, class I  35.48 
 
 
217 aa  80.1  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.632156  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03038  major anaerobically induced outer membrane transmembrane protein  36.61 
 
 
510 aa  79  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.490138  normal  0.0661846 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4128  nitrite reductase, copper-containing  37.5 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.91 
 
 
1306 aa  78.6  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4015  nitrite reductase, copper-containing  37.5 
 
 
499 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4896  cytochrome c class I  37.74 
 
 
142 aa  78.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1265  cytochrome c, class I  39.18 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1620  outer membrane nitrite reductase, putative  35.59 
 
 
189 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.704464  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  39.23 
 
 
1139 aa  76.6  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4625  cytochrome c class I  33.05 
 
 
197 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.887243  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0450  cytochrome c class I  34.55 
 
 
149 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0881  mulitcopper oxidase domain-containing protein  36.45 
 
 
516 aa  72.8  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.208672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2012  nitrite reductase, copper-containing  35.51 
 
 
516 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0755  putative outer membrane nitrite reductase  35.51 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0721126  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1658  putative outer membrane nitrite reductase  35.51 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179147  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0520  putative anaerobically induced outer membrane protein  35.51 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2107  nitrite reductase, copper-containing  35.51 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0593  putative outer membrane nitrite reductase  35.51 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0703  putative outer membrane nitrite reductase  35.51 
 
 
520 aa  71.2  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  25.16 
 
 
1110 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.56 
 
 
1084 aa  70.1  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1300  cytochrome c class I  31.3 
 
 
139 aa  69.3  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.793758 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  38.38 
 
 
548 aa  68.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  29.76 
 
 
1058 aa  68.6  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0473  cytochrome c class I  34.62 
 
 
268 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  29.06 
 
 
1201 aa  65.9  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2513  hypothetical protein  29.59 
 
 
140 aa  64.7  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2471  cytochrome c, class I  30.97 
 
 
450 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2986  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.82 
 
 
447 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.47949  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5206  cytochrome c class I  27.27 
 
 
145 aa  63.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0555  cytochrome c, class I  34.75 
 
 
407 aa  62.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.474157  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3607  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.63 
 
 
450 aa  63.2  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2294  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  31.25 
 
 
453 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6575  cytochrome c, class I  31.53 
 
 
554 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0822253  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.48 
 
 
1390 aa  62.4  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6799  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.69 
 
 
454 aa  62  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131117  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  29.37 
 
 
158 aa  62  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2783  cytochrome c class I  36.46 
 
 
151 aa  61.6  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.796513  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3623  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30.36 
 
 
447 aa  61.2  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2110  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  30.36 
 
 
447 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.375253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1926  cytochrome c class I  39.8 
 
 
150 aa  60.8  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015189 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6289  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  30.63 
 
 
530 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.550632  normal  0.0291984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1876  hypothetical protein  30.58 
 
 
775 aa  60.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6144  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.43 
 
 
527 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.548869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  29.93 
 
 
513 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  23.5 
 
 
1141 aa  59.7  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2492  cytochrome c, class I  30.95 
 
 
698 aa  59.7  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00140351  normal  0.928162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4201  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.82 
 
 
444 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0553584  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2280  cytochrome c, class I  34.15 
 
 
429 aa  59.7  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1294  cytochrome c, class I  32.38 
 
 
527 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0963416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  34.65 
 
 
528 aa  60.1  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6536  cytochrome c, class I  32.38 
 
 
527 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.403161  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5764  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.17 
 
 
447 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.729406  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4654  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  33.33 
 
 
429 aa  59.3  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2835  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.32 
 
 
448 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0245579  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0628  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.1 
 
 
432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5997  cytochrome c, class I  29.1 
 
 
432 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3778  cytochrome C oxidase mono-heme subunit/FixO  33.68 
 
 
331 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000025315  hitchhiker  0.00577808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5264  putative c-type cytochrome  27.33 
 
 
415 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1563  cytochrome c class I  30.77 
 
 
147 aa  58.2  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2974  putative cytochrome c precursor  29.86 
 
 
439 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.34008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  33.88 
 
 
402 aa  57.8  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2669  cytochrome c, class I  29.1 
 
 
432 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>