112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5487 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3707  membrane-bound dehydrogenase domain protein  56.19 
 
 		 968 aa  1153    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5487  membrane-bound dehydrogenase domain protein  100 
 
 		 1023 aa  2115    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.181879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5811  membrane-bound dehydrogenase domain protein  41.99 
 
 		 1040 aa  479  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.28 
 
 		 1201 aa  465  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3060  membrane-bound dehydrogenase domain protein  38.98 
 
 		 1027 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.329582  normal  0.577758 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3055  membrane-bound dehydrogenase domain protein  36.36 
 
 		 868 aa  389  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0279  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1286 aa  171  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.624688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4779  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.39 
 
 		 1162 aa  162  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1373  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.54 
 
 		 1149 aa  154  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.376333 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0666  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.23 
 
 		 1181 aa  149  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6210  heme-binding protein  25.86 
 
 		 1141 aa  127  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0656  membrane-bound dehydrogenase domain protein  27.61 
 
 		 1306 aa  126  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0724303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4698  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.15 
 
 		 1180 aa  125  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159588  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1957  heme-binding protein  24.45 
 
 		 1439 aa  117  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.585406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1564  membrane-bound dehydrogenase domain protein  26.85 
 
 		 1193 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  24.74 
 
 		 1143 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4288  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.56 
 
 		 1274 aa  110  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2449  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.42 
 
 		 762 aa  108  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.896022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2465  heme-binding protein  25.65 
 
 		 1137 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0332  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.82 
 
 		 705 aa  107  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.61 
 
 		 1171 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1972  heme-binding protein  24.03 
 
 		 1110 aa  106  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2734  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25.44 
 
 		 1084 aa  105  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.552836  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1153  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.6 
 
 		 864 aa  102  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6252  heme-binding protein  23.88 
 
 		 874 aa  99  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.62 
 
 		 1265 aa  99  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1262  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.66 
 
 		 1068 aa  97.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.261876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6338  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.24 
 
 		 957 aa  93.6  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4716  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.09 
 
 		 759 aa  92.8  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0863725  normal  0.0139154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4984  membrane-bound dehydrogenase domain protein  37.01 
 
 		 1055 aa  90.5  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380222 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  22.73 
 
 		 1058 aa  85.1  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0143  heme-binding protein  30.64 
 
 		 880 aa  84.7  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3985  membrane-bound dehydrogenase domain protein  24.37 
 
 		 852 aa  84  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.188405  normal  0.0691409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0353  membrane-bound dehydrogenase domain protein  23.14 
 
 		 1390 aa  84  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1407  heme-binding protein  25.35 
 
 		 1142 aa  80.5  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.258582  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0358  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.1 
 
 		 712 aa  76.6  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0965  heme-binding protein  24.38 
 
 		 902 aa  73.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.632027  normal  0.0425648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5354  membrane-bound dehydrogenase domain protein  34.21 
 
 		 951 aa  72.4  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0403  membrane-bound dehydrogenase domain protein  22.91 
 
 		 773 aa  72  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.572265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  24.13 
 
 		 460 aa  70.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1723  heme-binding protein  23.31 
 
 		 1077 aa  70.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.789867  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2803  membrane-bound dehydrogenase domain protein  28.37 
 
 		 1503 aa  69.7  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.772746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0902  heme-binding protein  27.88 
 
 		 1139 aa  68.6  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  23.61 
 
 		 621 aa  66.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  24.68 
 
 		 438 aa  65.1  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.48 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.48 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.48 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5000  membrane-bound dehydrogenase domain protein  21.79 
 
 		 749 aa  61.6  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.652472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1034  heme-binding protein  31.3 
 
 		 898 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.737373  normal  0.0957421 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4998  cytochrome c class I  28.26 
 
 		 756 aa  56.2  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0614505  normal  0.826099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.2 
 
 		 436 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3308  heme-binding protein  25.14 
 
 		 924 aa  55.5  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4536  heme-binding protein  25.2 
 
 		 168 aa  55.1  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.756231 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  22.19 
 
 		 428 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  25.66 
 
 		 1224 aa  54.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  26.3 
 
 		 438 aa  54.3  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  23.21 
 
 		 371 aa  53.5  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  22.19 
 
 		 428 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  24.93 
 
 		 381 aa  53.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  21.1 
 
 		 466 aa  52.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  24.24 
 
 		 396 aa  52.4  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.77 
 
 		 427 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  23.31 
 
 		 577 aa  52.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  22.05 
 
 		 601 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  24.19 
 
 		 376 aa  51.6  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  34.65 
 
 		 456 aa  51.6  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  23.5 
 
 		 445 aa  51.6  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  26.09 
 
 		 546 aa  51.2  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.32 
 
 		 423 aa  51.2  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  23.97 
 
 		 602 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  23.7 
 
 		 457 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 446 aa  50.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  29.41 
 
 		 446 aa  50.1  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.27 
 
 		 418 aa  50.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.11 
 
 		 587 aa  50.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  29.92 
 
 		 452 aa  50.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  23.48 
 
 		 442 aa  49.3  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  36.89 
 
 		 435 aa  49.3  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  22.91 
 
 		 384 aa  48.9  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  25.14 
 
 		 958 aa  48.5  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 		 418 aa  48.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  33.98 
 
 		 444 aa  48.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2103  cytochrome c class I  40 
 
 		 124 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2147  cytochrome c class I  40 
 
 		 124 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.620434 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  25 
 
 		 447 aa  48.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  29.46 
 
 		 442 aa  47.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  22.94 
 
 		 363 aa  47.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.84 
 
 		 1343 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  22.87 
 
 		 617 aa  47.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 		 451 aa  47.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  24.23 
 
 		 357 aa  46.6  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  21.64 
 
 		 433 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 		 448 aa  46.6  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 		 448 aa  46.6  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  29.46 
 
 		 442 aa  46.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  22.94 
 
 		 423 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  25.87 
 
 		 443 aa  46.2  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.19 
 
 		 448 aa  46.2  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 		 448 aa  46.2  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>