236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2796 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  98.21 
 
 		 448 aa  882    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  90.85 
 
 		 448 aa  835    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 448 aa  899    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  66.35 
 
 		 446 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  65.48 
 
 		 442 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  66.91 
 
 		 437 aa  556  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  64.2 
 
 		 442 aa  548  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  62.24 
 
 		 446 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  61.57 
 
 		 435 aa  543  1e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  59.13 
 
 		 456 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  61.32 
 
 		 452 aa  532  1e-150  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  66.59 
 
 		 451 aa  532  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  60.66 
 
 		 438 aa  526  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  62.32 
 
 		 447 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  60.42 
 
 		 461 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  60.77 
 
 		 440 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  60.93 
 
 		 447 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  61 
 
 		 454 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  60.05 
 
 		 447 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  60.55 
 
 		 438 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  57.91 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  59.61 
 
 		 448 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  58.09 
 
 		 445 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  54.34 
 
 		 465 aa  488  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  57.82 
 
 		 444 aa  488  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  53.12 
 
 		 454 aa  482  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  57.56 
 
 		 446 aa  476  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  56.39 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  56.39 
 
 		 485 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.22 
 
 		 448 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  51.69 
 
 		 525 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  54.68 
 
 		 446 aa  450  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  51.26 
 
 		 514 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  52.23 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  52.48 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  51.47 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  48.97 
 
 		 436 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  51.49 
 
 		 430 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  51.82 
 
 		 439 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  51.57 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  50.74 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  53.12 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  51.24 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50.62 
 
 		 433 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  49.55 
 
 		 501 aa  410  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  49.52 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.31 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  50.11 
 
 		 429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  48.43 
 
 		 422 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  49.88 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.09 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  48.93 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  50.86 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  48.65 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.7 
 
 		 420 aa  380  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  49.02 
 
 		 429 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  46.28 
 
 		 433 aa  376  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  47.43 
 
 		 438 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  48.77 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.64 
 
 		 423 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  45.52 
 
 		 421 aa  349  5e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  41.36 
 
 		 448 aa  287  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  38.38 
 
 		 446 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  38.15 
 
 		 437 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  37.86 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  38.4 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  33.85 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  32.41 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  35.86 
 
 		 396 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  32.52 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  34.91 
 
 		 361 aa  177  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.67 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.31 
 
 		 367 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.18 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.45 
 
 		 380 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.14 
 
 		 369 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.83 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  29.97 
 
 		 617 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  34.08 
 
 		 384 aa  159  8e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  30.15 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.23 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.23 
 
 		 403 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.12 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 		 381 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.84 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.33 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.53 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.52 
 
 		 380 aa  144  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.43 
 
 		 379 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  30.84 
 
 		 379 aa  143  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.84 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.13 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.13 
 
 		 390 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  30.84 
 
 		 379 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.84 
 
 		 379 aa  140  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.06 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.16 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  30.34 
 
 		 349 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.46 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.16 
 
 		 371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>