183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0129 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
501 aa  1016    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  53.96 
 
 
448 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  51.12 
 
 
456 aa  423  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  51.59 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  54.52 
 
 
447 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  50.34 
 
 
442 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  49.66 
 
 
448 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  52.1 
 
 
452 aa  411  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  50 
 
 
448 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  49.55 
 
 
448 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  53.3 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  54.03 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  49.43 
 
 
437 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  49.44 
 
 
435 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  51.54 
 
 
440 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  50.81 
 
 
438 aa  390  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  49.34 
 
 
461 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  50.23 
 
 
445 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  49.3 
 
 
447 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  50.12 
 
 
444 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  49.52 
 
 
465 aa  381  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  45.85 
 
 
447 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  48.45 
 
 
447 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  45.83 
 
 
454 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  45.64 
 
 
446 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  45.03 
 
 
525 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  46.32 
 
 
446 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  47.39 
 
 
454 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  48.73 
 
 
451 aa  360  2e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  46.7 
 
 
442 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  46.17 
 
 
485 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  46.17 
 
 
485 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  46.17 
 
 
514 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  48.06 
 
 
436 aa  338  9e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  47.06 
 
 
434 aa  336  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  46.19 
 
 
448 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.36 
 
 
457 aa  331  2e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  44.47 
 
 
430 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.98 
 
 
438 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  43.27 
 
 
439 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  43.73 
 
 
430 aa  325  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  45.59 
 
 
438 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  43.21 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  44.79 
 
 
430 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  45.78 
 
 
439 aa  319  7.999999999999999e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  41.35 
 
 
436 aa  318  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  44.31 
 
 
430 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  42.96 
 
 
430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  42.96 
 
 
430 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  44.29 
 
 
429 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  45.26 
 
 
429 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  44.29 
 
 
429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.21 
 
 
433 aa  306  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  44.24 
 
 
429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  41.58 
 
 
421 aa  303  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.16 
 
 
420 aa  302  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  41.4 
 
 
473 aa  300  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  42.36 
 
 
433 aa  297  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  41.16 
 
 
438 aa  295  2e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  40.73 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.9 
 
 
423 aa  281  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  40.36 
 
 
448 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  36.76 
 
 
446 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  36.36 
 
 
546 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  36.75 
 
 
437 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  37.14 
 
 
363 aa  200  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  39.38 
 
 
396 aa  187  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  37.81 
 
 
361 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  33.16 
 
 
418 aa  168  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  33.25 
 
 
617 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  32.16 
 
 
398 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  29.44 
 
 
460 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.68 
 
 
380 aa  150  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.01 
 
 
388 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.33 
 
 
369 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  30.25 
 
 
423 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 
411 aa  146  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.25 
 
 
369 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.38 
 
 
367 aa  143  9e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.65 
 
 
373 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  31.03 
 
 
381 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.94 
 
 
390 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.94 
 
 
390 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.29 
 
 
379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  34.06 
 
 
384 aa  137  5e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.44 
 
 
361 aa  137  5e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  33.75 
 
 
371 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.63 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.63 
 
 
390 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.5 
 
 
379 aa  136  8e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.3 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.97 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.63 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.63 
 
 
403 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.46 
 
 
391 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.28 
 
 
371 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.39 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.28 
 
 
387 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.05 
 
 
391 aa  134  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>