188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2479 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 		 438 aa  876    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  73.84 
 
 		 457 aa  652    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  73.44 
 
 		 434 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  75.12 
 
 		 436 aa  650    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  70.86 
 
 		 429 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  68.22 
 
 		 429 aa  591  1e-168  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  68.46 
 
 		 429 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  67.99 
 
 		 429 aa  588  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  56.97 
 
 		 442 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  58.09 
 
 		 438 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  56.97 
 
 		 442 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  56.91 
 
 		 445 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  54.21 
 
 		 456 aa  434  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  57.11 
 
 		 435 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  55.85 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  55.64 
 
 		 444 aa  429  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  52.42 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  56.13 
 
 		 446 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  55.88 
 
 		 437 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  54.99 
 
 		 447 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  54.85 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  56.02 
 
 		 446 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  53.64 
 
 		 454 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  55.21 
 
 		 447 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  54.25 
 
 		 452 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  53.55 
 
 		 446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  52.31 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  53.04 
 
 		 448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  53.16 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  54.38 
 
 		 451 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  52.78 
 
 		 465 aa  405  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  52.38 
 
 		 461 aa  398  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  54.07 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  51.09 
 
 		 442 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.81 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  50.37 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  49.51 
 
 		 439 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  51.84 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  50.12 
 
 		 439 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  52.21 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  50.12 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  48.28 
 
 		 436 aa  365  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  48.3 
 
 		 438 aa  364  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  45.35 
 
 		 422 aa  360  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.57 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  48.32 
 
 		 430 aa  356  5e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  47.57 
 
 		 430 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  47.6 
 
 		 430 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  47.84 
 
 		 430 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  47.84 
 
 		 430 aa  352  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  48.43 
 
 		 525 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  46.6 
 
 		 430 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  46.52 
 
 		 473 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  49.03 
 
 		 485 aa  344  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  49.03 
 
 		 485 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.99 
 
 		 433 aa  344  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  45.81 
 
 		 421 aa  342  9e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.17 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  46.39 
 
 		 514 aa  332  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  48.98 
 
 		 501 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  46.51 
 
 		 447 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  40.96 
 
 		 448 aa  278  1e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 546 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  38.19 
 
 		 446 aa  249  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  35.7 
 
 		 437 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  38.07 
 
 		 363 aa  196  9e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  34.23 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  32.16 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  35.47 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  33.15 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.33 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.06 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.06 
 
 		 403 aa  143  7e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.53 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.79 
 
 		 371 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.79 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.14 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.96 
 
 		 361 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  29.84 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  28.3 
 
 		 617 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  26.02 
 
 		 411 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  31.85 
 
 		 410 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  30.27 
 
 		 423 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.72 
 
 		 388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.91 
 
 		 424 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.52 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.68 
 
 		 362 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  33.22 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.19 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.19 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  32.44 
 
 		 389 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.19 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  32.44 
 
 		 355 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.67 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  35.62 
 
 		 380 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.67 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  27.05 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  30.95 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.91 
 
 		 379 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>