263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1002 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 363 aa  736    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  47.51 
 
 		 396 aa  297  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  46.48 
 
 		 460 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  45.75 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  41.23 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  46.11 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.74 
 
 		 423 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.45 
 
 		 420 aa  269  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  42.6 
 
 		 438 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  41.3 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  41.3 
 
 		 403 aa  267  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  41.89 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  40.92 
 
 		 363 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  42.93 
 
 		 437 aa  256  6e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  41.46 
 
 		 421 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  42.05 
 
 		 546 aa  253  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  42.18 
 
 		 446 aa  252  7e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  40.92 
 
 		 363 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  40.23 
 
 		 617 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  39.3 
 
 		 439 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  40.27 
 
 		 422 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  37.87 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.01 
 
 		 433 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.35 
 
 		 436 aa  242  7e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.82 
 
 		 379 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.65 
 
 		 371 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  39.37 
 
 		 381 aa  239  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.07 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  39.6 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  38.98 
 
 		 446 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  40 
 
 		 357 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.34 
 
 		 361 aa  235  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  38.8 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  39.47 
 
 		 448 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  39.15 
 
 		 357 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  37.67 
 
 		 410 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  38.44 
 
 		 442 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  39.04 
 
 		 448 aa  230  4e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  37.91 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  38.4 
 
 		 448 aa  229  5e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  39.31 
 
 		 394 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  37.9 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  38.89 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  38.62 
 
 		 447 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  38.34 
 
 		 446 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  38.77 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.06 
 
 		 390 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.54 
 
 		 388 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.06 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.06 
 
 		 390 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.77 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.28 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  38.37 
 
 		 380 aa  225  8e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  38.94 
 
 		 430 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  38.44 
 
 		 430 aa  225  9e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  37.99 
 
 		 446 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  36.86 
 
 		 371 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  37.09 
 
 		 369 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  38.19 
 
 		 430 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  37.15 
 
 		 361 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.33 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.33 
 
 		 391 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  37.97 
 
 		 430 aa  222  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.51 
 
 		 387 aa  222  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  37.97 
 
 		 430 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.62 
 
 		 391 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  36.73 
 
 		 437 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  38.44 
 
 		 377 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.84 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.71 
 
 		 391 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.18 
 
 		 380 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  39.2 
 
 		 408 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  40.1 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  37.44 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  38.4 
 
 		 446 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  39.33 
 
 		 424 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  37.2 
 
 		 465 aa  219  5e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  37.57 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  39.48 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  39.48 
 
 		 372 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  39.48 
 
 		 355 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.03 
 
 		 386 aa  218  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  37 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  37.46 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  38.15 
 
 		 461 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  37.37 
 
 		 473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  36.88 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  38.17 
 
 		 435 aa  216  4e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  37.46 
 
 		 379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.19 
 
 		 419 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  36.27 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  34.4 
 
 		 371 aa  215  8e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  37.57 
 
 		 429 aa  215  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  38.15 
 
 		 394 aa  215  9e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.52 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  37.33 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  36.87 
 
 		 440 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.58 
 
 		 448 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  38.75 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>