More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2980 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  100 
 
 		 398 aa  816    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  58.81 
 
 		 396 aa  462  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  41.86 
 
 		 363 aa  277  3e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.3 
 
 		 371 aa  269  5e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.4 
 
 		 379 aa  263  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  42.11 
 
 		 460 aa  262  6e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.4 
 
 		 436 aa  262  8.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  37.84 
 
 		 391 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  41.85 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  35.89 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  39.46 
 
 		 617 aa  247  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  37.37 
 
 		 384 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  36.5 
 
 		 411 aa  245  9e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.83 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  36.67 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.06 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  38.84 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.06 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.06 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  37.29 
 
 		 371 aa  235  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.31 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  37.68 
 
 		 363 aa  233  5e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  37.75 
 
 		 394 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  37.04 
 
 		 377 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  38.32 
 
 		 439 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  36.92 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  39.13 
 
 		 642 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.07 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  38.14 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  35.56 
 
 		 423 aa  226  4e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  35.73 
 
 		 357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.9 
 
 		 371 aa  225  9e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  37.75 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.67 
 
 		 361 aa  224  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.21 
 
 		 388 aa  224  3e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.37 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.19 
 
 		 369 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  38.66 
 
 		 408 aa  222  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.8 
 
 		 466 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.43 
 
 		 423 aa  220  3e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.81 
 
 		 379 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  36.44 
 
 		 349 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 		 389 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.54 
 
 		 373 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  36.13 
 
 		 355 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.15 
 
 		 388 aa  218  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.36 
 
 		 369 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.96 
 
 		 391 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  34.6 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.03 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.36 
 
 		 380 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.88 
 
 		 391 aa  215  9e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  35.57 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.33 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.15 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.15 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.94 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.34 
 
 		 419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  36 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36 
 
 		 379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.99 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.67 
 
 		 390 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  34.96 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.67 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.67 
 
 		 390 aa  212  7e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.38 
 
 		 390 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.26 
 
 		 386 aa  212  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  37.43 
 
 		 448 aa  210  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  36.19 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.06 
 
 		 391 aa  208  2e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  36.68 
 
 		 421 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  34.97 
 
 		 546 aa  206  5e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  35.96 
 
 		 446 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  35.14 
 
 		 440 aa  200  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  35.68 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  35.71 
 
 		 376 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  33.96 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.68 
 
 		 448 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.22 
 
 		 433 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  33.69 
 
 		 442 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 		 446 aa  193  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  33.69 
 
 		 514 aa  193  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 		 485 aa  193  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  34.13 
 
 		 485 aa  192  6e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  32.25 
 
 		 446 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.83 
 
 		 437 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 446 aa  190  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 444 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  33.6 
 
 		 447 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  32.91 
 
 		 430 aa  187  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 		 448 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  32.43 
 
 		 447 aa  187  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 447 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.1 
 
 		 456 aa  185  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.5 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.52 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>