296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I1660 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  95.07 
 
 
355 aa  676    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  100 
 
 
419 aa  848    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  91.52 
 
 
389 aa  706    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  93.24 
 
 
372 aa  690    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  91.14 
 
 
316 aa  558  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  75.29 
 
 
379 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  76.68 
 
 
379 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  93.27 
 
 
299 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  76.61 
 
 
379 aa  548  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  74.14 
 
 
379 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  74.14 
 
 
379 aa  547  1e-154  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  75.66 
 
 
379 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  75.44 
 
 
379 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  70.38 
 
 
394 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  69.3 
 
 
394 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  67.25 
 
 
357 aa  475  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  66.19 
 
 
357 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  59.18 
 
 
391 aa  441  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  62.1 
 
 
377 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  59.36 
 
 
436 aa  415  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  59.44 
 
 
362 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  54.14 
 
 
371 aa  404  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  58.41 
 
 
379 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  54.65 
 
 
381 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  55.99 
 
 
371 aa  398  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  51.68 
 
 
363 aa  393  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  52.92 
 
 
384 aa  389  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  51.4 
 
 
363 aa  388  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  56.87 
 
 
376 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56.58 
 
 
466 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  50.69 
 
 
361 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.95 
 
 
371 aa  362  5.0000000000000005e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  46.72 
 
 
367 aa  359  4e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  52.72 
 
 
349 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.03 
 
 
369 aa  351  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  50.96 
 
 
424 aa  350  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  46.76 
 
 
369 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.35 
 
 
361 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  48.03 
 
 
380 aa  343  4e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  47.4 
 
 
417 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  45.95 
 
 
417 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  45.3 
 
 
425 aa  323  4e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  49.13 
 
 
380 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  44.48 
 
 
642 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  38.3 
 
 
394 aa  260  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.56 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.25 
 
 
390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  37.63 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.98 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.52 
 
 
386 aa  253  6e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.83 
 
 
391 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.98 
 
 
390 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.98 
 
 
390 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.11 
 
 
391 aa  250  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  42.02 
 
 
396 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.4 
 
 
391 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.47 
 
 
391 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.47 
 
 
391 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.03 
 
 
380 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.8 
 
 
373 aa  246  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.96 
 
 
391 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  37.25 
 
 
419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  39.89 
 
 
423 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.71 
 
 
387 aa  236  6e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.39 
 
 
428 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  37.85 
 
 
420 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  39.83 
 
 
428 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.5 
 
 
418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.28 
 
 
427 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  36.74 
 
 
419 aa  221  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  38.27 
 
 
422 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  38.83 
 
 
418 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  38.35 
 
 
460 aa  218  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  41.32 
 
 
419 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  38.55 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  39.19 
 
 
363 aa  216  9e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  35.38 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.51 
 
 
403 aa  212  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.51 
 
 
403 aa  212  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  32.71 
 
 
379 aa  209  6e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  35.12 
 
 
423 aa  204  3e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  31.37 
 
 
411 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  33 
 
 
410 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  35.55 
 
 
617 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  32.39 
 
 
546 aa  176  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.99 
 
 
420 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  34.58 
 
 
448 aa  176  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  34.46 
 
 
446 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32 
 
 
423 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  29.8 
 
 
421 aa  170  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  33.24 
 
 
408 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.96 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  35.22 
 
 
438 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 
433 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.89 
 
 
433 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  35.67 
 
 
430 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  31.35 
 
 
430 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  35.33 
 
 
430 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  31.08 
 
 
430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  33.67 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>