223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5064 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 422 aa  871    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  60.35 
 
 		 439 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  57.28 
 
 		 433 aa  483  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  57.72 
 
 		 420 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  56.86 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56.2 
 
 		 423 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  55.05 
 
 		 421 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  51.38 
 
 		 446 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  51.97 
 
 		 454 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  51.96 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  52.2 
 
 		 442 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  49.39 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  51.46 
 
 		 442 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  50.86 
 
 		 448 aa  411  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  50.24 
 
 		 447 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  50.86 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  50.61 
 
 		 447 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  49.5 
 
 		 435 aa  408  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  51.36 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  48.09 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  51.95 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  49.5 
 
 		 438 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  48.65 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  48.54 
 
 		 448 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  48.53 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  48.26 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  48.43 
 
 		 448 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  48.29 
 
 		 446 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  50.49 
 
 		 454 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  48.67 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  49.38 
 
 		 465 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  47.55 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  48.2 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  46.25 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  45.74 
 
 		 436 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  48.7 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  47.9 
 
 		 439 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  47.41 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.35 
 
 		 438 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.69 
 
 		 448 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.59 
 
 		 457 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  46.15 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  43.38 
 
 		 434 aa  352  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.13 
 
 		 433 aa  349  6e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  43.38 
 
 		 485 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  43.38 
 
 		 485 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  43.03 
 
 		 436 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  44.62 
 
 		 429 aa  335  7e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  42.21 
 
 		 525 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  42.79 
 
 		 429 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  43.78 
 
 		 473 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  42.55 
 
 		 429 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  40.79 
 
 		 514 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  44.58 
 
 		 430 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  43.66 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  44.09 
 
 		 430 aa  325  9e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  43.41 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  43.41 
 
 		 430 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  42.93 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  44.61 
 
 		 448 aa  322  8e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  44.44 
 
 		 447 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  42.08 
 
 		 446 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  40.73 
 
 		 501 aa  285  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  38.86 
 
 		 546 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  38.06 
 
 		 437 aa  263  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  40.27 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  35.31 
 
 		 418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  36.19 
 
 		 398 aa  209  6e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  34.32 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  32.2 
 
 		 460 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  32.09 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.1 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.75 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.23 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.23 
 
 		 403 aa  170  5e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  29.33 
 
 		 617 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.37 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  30.83 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  29.79 
 
 		 411 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.18 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.99 
 
 		 379 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  32.24 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  35.39 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.53 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  28.53 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  28.53 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.53 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  34.75 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.27 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.09 
 
 		 379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  29.85 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.63 
 
 		 424 aa  153  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  32.08 
 
 		 349 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.68 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.61 
 
 		 369 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  30.81 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.09 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.35 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>