More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5288 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  100 
 
 		 617 aa  1252    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  54.43 
 
 		 411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  52.7 
 
 		 410 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  48.39 
 
 		 423 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.77 
 
 		 388 aa  276  7e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  40.1 
 
 		 396 aa  257  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  40.23 
 
 		 363 aa  250  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  39.46 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  34.34 
 
 		 381 aa  238  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  37.78 
 
 		 418 aa  233  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.72 
 
 		 371 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  36.08 
 
 		 384 aa  230  4e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.36 
 
 		 371 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.18 
 
 		 379 aa  228  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  37.63 
 
 		 460 aa  226  6e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.77 
 
 		 367 aa  226  8e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  39.33 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.78 
 
 		 403 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.78 
 
 		 403 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.41 
 
 		 436 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  36.97 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.14 
 
 		 361 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  37.25 
 
 		 357 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.45 
 
 		 369 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.71 
 
 		 362 aa  213  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  36.69 
 
 		 379 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.23 
 
 		 361 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.21 
 
 		 380 aa  210  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.73 
 
 		 379 aa  210  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.44 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.99 
 
 		 371 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  34.67 
 
 		 642 aa  207  6e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  32.76 
 
 		 363 aa  206  1e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.82 
 
 		 379 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  34.87 
 
 		 369 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  37.82 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.82 
 
 		 379 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  36.36 
 
 		 391 aa  204  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  37.5 
 
 		 357 aa  203  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  36.52 
 
 		 446 aa  204  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  36.54 
 
 		 377 aa  203  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  35.53 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  37.54 
 
 		 379 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.77 
 
 		 423 aa  201  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.1 
 
 		 466 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  35.84 
 
 		 389 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  35.84 
 
 		 372 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.7 
 
 		 391 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  31.73 
 
 		 363 aa  198  3e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  35.84 
 
 		 355 aa  198  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  33.03 
 
 		 416 aa  198  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.37 
 
 		 391 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  32.84 
 
 		 394 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.24 
 
 		 391 aa  196  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.55 
 
 		 419 aa  196  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.09 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  34.87 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  34.75 
 
 		 380 aa  194  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.91 
 
 		 391 aa  194  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.62 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.62 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  36.18 
 
 		 424 aa  191  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  33.69 
 
 		 408 aa  189  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  33.69 
 
 		 439 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  35.64 
 
 		 430 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  34.97 
 
 		 349 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.2 
 
 		 390 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.2 
 
 		 390 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.24 
 
 		 387 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  30.2 
 
 		 525 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.92 
 
 		 390 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  34.47 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  31.47 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.92 
 
 		 390 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.55 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.81 
 
 		 388 aa  179  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  33.51 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 446 aa  178  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  32.34 
 
 		 447 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  31.89 
 
 		 421 aa  177  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.38 
 
 		 373 aa  177  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  33.6 
 
 		 448 aa  177  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.44 
 
 		 380 aa  176  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.43 
 
 		 386 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  31.71 
 
 		 394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  28.64 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.98 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 		 447 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  32.45 
 
 		 442 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 		 438 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  33.16 
 
 		 423 aa  173  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  30.91 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  28.95 
 
 		 514 aa  171  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  30.91 
 
 		 485 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  31.15 
 
 		 446 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  30.71 
 
 		 454 aa  169  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  29.33 
 
 		 422 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  30.83 
 
 		 438 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.9 
 
 		 456 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>