More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0415 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
416 aa  845    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  47.31 
 
 
408 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  43.21 
 
 
430 aa  297  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.47 
 
 
403 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.47 
 
 
403 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  36.79 
 
 
418 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  37.67 
 
 
460 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  33.03 
 
 
617 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  33.94 
 
 
411 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  35.11 
 
 
363 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  31.52 
 
 
381 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.04 
 
 
388 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
398 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  30.09 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.48 
 
 
436 aa  171  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  35.05 
 
 
379 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  27.96 
 
 
363 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  31.22 
 
 
384 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  33.89 
 
 
396 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  27.18 
 
 
363 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.42 
 
 
367 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.32 
 
 
371 aa  162  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  31.74 
 
 
423 aa  160  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.22 
 
 
371 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.73 
 
 
361 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 
437 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 
642 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  33.77 
 
 
448 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.27 
 
 
424 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.87 
 
 
391 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.5 
 
 
369 aa  144  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  30.22 
 
 
380 aa  144  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  30.95 
 
 
446 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.14 
 
 
466 aa  140  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.98 
 
 
369 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.37 
 
 
362 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.81 
 
 
379 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.58 
 
 
357 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.45 
 
 
379 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.5 
 
 
377 aa  138  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  32.18 
 
 
379 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.18 
 
 
379 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.78 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.04 
 
 
357 aa  137  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.75 
 
 
427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.75 
 
 
427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.75 
 
 
427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  31.46 
 
 
349 aa  136  9e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  32.27 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.07 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.39 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.39 
 
 
390 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.39 
 
 
379 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.39 
 
 
390 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.44 
 
 
361 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.42 
 
 
373 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.13 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.95 
 
 
423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.86 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 
389 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  29.71 
 
 
372 aa  130  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  29.71 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  25.3 
 
 
371 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  29.63 
 
 
438 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.7 
 
 
391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  28.35 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28 
 
 
388 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  29.69 
 
 
430 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  29.06 
 
 
394 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  29.69 
 
 
430 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.81 
 
 
391 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.81 
 
 
391 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.7 
 
 
443 aa  127  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  30.96 
 
 
546 aa  127  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.33 
 
 
428 aa  126  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.55 
 
 
419 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  28.98 
 
 
363 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.42 
 
 
391 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.68 
 
 
433 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.54 
 
 
387 aa  124  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.38 
 
 
376 aa  124  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  30.54 
 
 
434 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.91 
 
 
425 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.2 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  29.54 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  29.4 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  30.52 
 
 
444 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.1 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.32 
 
 
420 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  29.56 
 
 
473 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.8 
 
 
380 aa  119  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
447 aa  120  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.44 
 
 
456 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
433 aa  119  9e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.38 
 
 
419 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.98 
 
 
417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.26 
 
 
391 aa  116  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>