200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0146 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  100 
 
 
438 aa  860    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  78.91 
 
 
443 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  70.09 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  70.09 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  70.09 
 
 
427 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 
418 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  37.27 
 
 
460 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  34.58 
 
 
396 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  33.33 
 
 
398 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.4 
 
 
403 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.4 
 
 
403 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  31.64 
 
 
381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  34.32 
 
 
363 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  30.59 
 
 
444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 
430 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  32.08 
 
 
430 aa  153  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  31.65 
 
 
384 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.79 
 
 
420 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  34.54 
 
 
446 aa  150  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  31.58 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.06 
 
 
362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  31.1 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.42 
 
 
433 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  32.08 
 
 
473 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  31.45 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  31.45 
 
 
430 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  27.6 
 
 
421 aa  146  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  30.93 
 
 
617 aa  144  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  34.02 
 
 
435 aa  144  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  31.96 
 
 
446 aa  143  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  30.99 
 
 
442 aa  143  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  32.05 
 
 
434 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.37 
 
 
436 aa  142  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 
461 aa  141  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  33.14 
 
 
440 aa  140  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.83 
 
 
391 aa  139  7e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  31.28 
 
 
379 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  32.26 
 
 
447 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.54 
 
 
457 aa  139  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 
425 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  28.06 
 
 
430 aa  138  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  31.2 
 
 
525 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.57 
 
 
367 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  31.19 
 
 
446 aa  138  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.1 
 
 
371 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  30.61 
 
 
445 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 
439 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.46 
 
 
451 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  31.49 
 
 
452 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  31.7 
 
 
514 aa  137  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  31.29 
 
 
437 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  30.95 
 
 
446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  31.49 
 
 
546 aa  136  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
433 aa  136  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.3 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.28 
 
 
456 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.67 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.48 
 
 
379 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.92 
 
 
436 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  31.56 
 
 
448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  28.39 
 
 
416 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  30.9 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.93 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 
438 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  28.9 
 
 
448 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.72 
 
 
424 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  30.32 
 
 
439 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  27.58 
 
 
442 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
410 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  28.38 
 
 
363 aa  132  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 
448 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.6 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.47 
 
 
419 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.84 
 
 
371 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.04 
 
 
361 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  29.87 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  31.02 
 
 
436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  31.88 
 
 
447 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  30 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 
454 aa  130  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.21 
 
 
379 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  30.93 
 
 
355 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.45 
 
 
429 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  30.11 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 
372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  32.03 
 
 
447 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  30.4 
 
 
379 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.4 
 
 
379 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.66 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.39 
 
 
371 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.13 
 
 
437 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.42 
 
 
377 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  27.09 
 
 
422 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0961  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.47 
 
 
392 aa  126  7e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>