191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0961 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0961  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  100 
 
 
392 aa  792    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  31.2 
 
 
363 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  31.47 
 
 
438 aa  127  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 
418 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 
408 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 
437 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  30.14 
 
 
398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  31.23 
 
 
416 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.62 
 
 
443 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.49 
 
 
388 aa  114  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.29 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.29 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.29 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.83 
 
 
403 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.83 
 
 
403 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  30.94 
 
 
617 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  33 
 
 
396 aa  107  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  27.42 
 
 
642 aa  104  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.4 
 
 
423 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.76 
 
 
427 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.11 
 
 
423 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.2 
 
 
448 aa  99.4  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 
448 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  30.38 
 
 
448 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.55 
 
 
420 aa  97.1  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  30.82 
 
 
440 aa  96.7  7e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.1 
 
 
428 aa  96.3  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.53 
 
 
419 aa  96.3  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  26.3 
 
 
411 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.9 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  26.19 
 
 
438 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  26.11 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  29.69 
 
 
448 aa  94  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  26.56 
 
 
430 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  30.82 
 
 
446 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.42 
 
 
457 aa  92.8  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.06 
 
 
428 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  28.9 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  27.35 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.32 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.35 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  26.55 
 
 
546 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  30.74 
 
 
446 aa  90.9  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
436 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  27.42 
 
 
379 aa  90.1  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 
438 aa  90.1  6e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.92 
 
 
436 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.07 
 
 
391 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  26.41 
 
 
454 aa  88.2  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  29.69 
 
 
461 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  29.55 
 
 
445 aa  88.6  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  26.17 
 
 
381 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  29.86 
 
 
442 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 
448 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  27.87 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.88 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  26.8 
 
 
439 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  26.59 
 
 
379 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.51 
 
 
433 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.88 
 
 
438 aa  86.7  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 
447 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 
434 aa  86.3  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.39 
 
 
357 aa  86.3  9e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  29.47 
 
 
446 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.4 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  30.4 
 
 
429 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  30.45 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.43 
 
 
371 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.2 
 
 
418 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  24.56 
 
 
430 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.53 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  28.03 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  25.81 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.45 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  28.49 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  24.81 
 
 
430 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 
447 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.36 
 
 
377 aa  84  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  24.33 
 
 
384 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.81 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.72 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 
442 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.33 
 
 
362 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.72 
 
 
429 aa  83.2  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  26.67 
 
 
446 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  27.6 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  25.25 
 
 
430 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  25.34 
 
 
419 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.64 
 
 
388 aa  82  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.29 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  27.09 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  24.49 
 
 
430 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  26.68 
 
 
421 aa  81.3  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  27.18 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  27.02 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  30.39 
 
 
514 aa  80.9  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  29.7 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.09 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  25.44 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>