More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2218 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
430 aa  886    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  56.06 
 
 
408 aa  432  1e-120  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  43.21 
 
 
416 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.7 
 
 
403 aa  232  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.7 
 
 
403 aa  232  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  35.97 
 
 
418 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  36.86 
 
 
363 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  37.76 
 
 
460 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  35.27 
 
 
381 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 
411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  35.64 
 
 
617 aa  189  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  33.67 
 
 
384 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  32.91 
 
 
398 aa  186  5e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  31.99 
 
 
410 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.77 
 
 
371 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.65 
 
 
436 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.77 
 
 
379 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.24 
 
 
391 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.75 
 
 
361 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.33 
 
 
367 aa  170  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  33.5 
 
 
396 aa  170  6e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 
423 aa  167  4e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.22 
 
 
371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.5 
 
 
357 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.5 
 
 
357 aa  161  3e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.3 
 
 
377 aa  158  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.08 
 
 
362 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  30.28 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  30.96 
 
 
394 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  28.75 
 
 
363 aa  149  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  30.6 
 
 
371 aa  149  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  31.39 
 
 
417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  30.71 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  31.8 
 
 
425 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.34 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.34 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 
389 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.75 
 
 
419 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 
372 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.25 
 
 
379 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.11 
 
 
390 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.19 
 
 
388 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.37 
 
 
379 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  30.12 
 
 
417 aa  143  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.03 
 
 
380 aa  142  8e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  28.68 
 
 
379 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.68 
 
 
379 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.87 
 
 
390 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  28.75 
 
 
355 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  30.6 
 
 
423 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.87 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  29.51 
 
 
642 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  28.46 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 
437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.77 
 
 
373 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.36 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.36 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.36 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  28.46 
 
 
379 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.43 
 
 
379 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.29 
 
 
391 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.15 
 
 
424 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.55 
 
 
387 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.29 
 
 
386 aa  138  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 
394 aa  138  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.13 
 
 
391 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.47 
 
 
438 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.95 
 
 
391 aa  137  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.95 
 
 
391 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.95 
 
 
391 aa  136  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.2 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.79 
 
 
361 aa  133  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 
419 aa  134  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.47 
 
 
466 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.11 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.92 
 
 
443 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  29.05 
 
 
438 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.11 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.56 
 
 
428 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.31 
 
 
380 aa  131  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  28.89 
 
 
419 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  27.79 
 
 
546 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  28.43 
 
 
446 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.06 
 
 
428 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.67 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  28.51 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.5 
 
 
422 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.48 
 
 
587 aa  127  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.61 
 
 
418 aa  124  4e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.35 
 
 
418 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.85 
 
 
418 aa  122  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  28.51 
 
 
430 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 
419 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  28.21 
 
 
349 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.12 
 
 
427 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  25.93 
 
 
457 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  27.63 
 
 
379 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  28.06 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.03 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.93 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>