More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0627 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 411 aa  862    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  61.6 
 
 		 410 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  56.52 
 
 		 617 aa  444  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  47.88 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.03 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  41.28 
 
 		 396 aa  257  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  40.99 
 
 		 460 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  39.19 
 
 		 398 aa  243  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  37.32 
 
 		 381 aa  242  7e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.39 
 
 		 371 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  38.95 
 
 		 418 aa  241  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.1 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  39.6 
 
 		 363 aa  237  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  35.84 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.85 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.85 
 
 		 403 aa  228  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  38.94 
 
 		 448 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  37.15 
 
 		 446 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.31 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.01 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  38.7 
 
 		 642 aa  222  8e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  36.02 
 
 		 371 aa  219  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  34.66 
 
 		 371 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  37.25 
 
 		 357 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.97 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 437 aa  217  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.06 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.57 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  35.43 
 
 		 379 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.82 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  34.84 
 
 		 438 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  34.68 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.82 
 
 		 379 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  35.39 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  34.9 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  36.41 
 
 		 380 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 466 aa  211  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.65 
 
 		 379 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  34.29 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  34.65 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.65 
 
 		 379 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  34.38 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 		 408 aa  208  1e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  33.62 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  35.24 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.8 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.91 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 389 aa  202  9e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.43 
 
 		 391 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  33.43 
 
 		 372 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  32.95 
 
 		 355 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.24 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.51 
 
 		 373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  32.42 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.58 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.75 
 
 		 391 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  33.43 
 
 		 394 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.88 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  33.43 
 
 		 394 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.59 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  34.47 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.17 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.17 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.27 
 
 		 420 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.3 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.59 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.59 
 
 		 390 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  35.79 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.69 
 
 		 388 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  35.43 
 
 		 546 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  34.19 
 
 		 421 aa  189  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.98 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.46 
 
 		 391 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  33.94 
 
 		 416 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.43 
 
 		 362 aa  187  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  33.15 
 
 		 439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.71 
 
 		 423 aa  183  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  34.16 
 
 		 423 aa  180  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.43 
 
 		 380 aa  179  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.39 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  30.14 
 
 		 376 aa  171  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  31.45 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  30.85 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  29.79 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  31.23 
 
 		 419 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  30.05 
 
 		 442 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 		 439 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.92 
 
 		 423 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.5 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  28.27 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 425 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  29.4 
 
 		 454 aa  157  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  28.84 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  31.2 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  31.9 
 
 		 514 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  29.32 
 
 		 485 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>