More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1756 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
408 aa  827    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  54.07 
 
 
430 aa  432  1e-120  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  47.31 
 
 
416 aa  325  7e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  40.26 
 
 
418 aa  250  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  42.7 
 
 
460 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.36 
 
 
403 aa  229  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.36 
 
 
403 aa  229  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  37.59 
 
 
398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  39.2 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  36.5 
 
 
381 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  38.83 
 
 
396 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  35.79 
 
 
411 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  34.13 
 
 
384 aa  203  5e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.6 
 
 
379 aa  199  6e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.5 
 
 
436 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.57 
 
 
371 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  32.7 
 
 
363 aa  190  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  33.88 
 
 
617 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  34.31 
 
 
371 aa  187  3e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  36.19 
 
 
357 aa  186  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  31.89 
 
 
363 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.98 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  34.59 
 
 
423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  32.8 
 
 
410 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.24 
 
 
357 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.87 
 
 
361 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.43 
 
 
391 aa  179  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  34.68 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.08 
 
 
388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  32.71 
 
 
394 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.71 
 
 
391 aa  169  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
389 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  32.62 
 
 
394 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 
372 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.95 
 
 
390 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  33.51 
 
 
355 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.95 
 
 
390 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.95 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.24 
 
 
419 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.13 
 
 
387 aa  167  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  32.98 
 
 
446 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.2 
 
 
391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.69 
 
 
390 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.02 
 
 
388 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.69 
 
 
362 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.56 
 
 
391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.26 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  30.69 
 
 
371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.75 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.75 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.66 
 
 
437 aa  163  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.88 
 
 
379 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.79 
 
 
379 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  33.6 
 
 
379 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.6 
 
 
379 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  30.54 
 
 
361 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.51 
 
 
466 aa  160  4e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.1 
 
 
391 aa  160  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.15 
 
 
423 aa  159  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.42 
 
 
379 aa  159  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.35 
 
 
369 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  33.51 
 
 
379 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  32.34 
 
 
379 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.35 
 
 
369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  28.43 
 
 
394 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.09 
 
 
380 aa  155  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  29.8 
 
 
642 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.66 
 
 
417 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.53 
 
 
417 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.93 
 
 
420 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.94 
 
 
424 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.84 
 
 
380 aa  149  9e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  31.66 
 
 
438 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.73 
 
 
587 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  32.19 
 
 
448 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  30.15 
 
 
423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  31.94 
 
 
349 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  30.08 
 
 
546 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.35 
 
 
425 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.31 
 
 
380 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.6 
 
 
376 aa  142  7e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.03 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  32.84 
 
 
439 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.23 
 
 
428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.08 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.3 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 
433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  33.11 
 
 
316 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  33.11 
 
 
299 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  29.22 
 
 
421 aa  134  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.63 
 
 
448 aa  133  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  29.87 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.17 
 
 
419 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0124  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.08 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  30.08 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0134  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.08 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0143  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  30.08 
 
 
427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0961  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  30.62 
 
 
392 aa  125  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  28.4 
 
 
422 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.67 
 
 
418 aa  123  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.230445 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>