More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0535 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
642 aa  1308    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  50.55 
 
 
371 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  50.29 
 
 
384 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  48.92 
 
 
367 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  51.16 
 
 
379 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.99 
 
 
436 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  50.58 
 
 
361 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  46.48 
 
 
381 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  49.28 
 
 
363 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  49.28 
 
 
363 aa  324  4e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  49.56 
 
 
394 aa  323  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  48.68 
 
 
394 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  44.9 
 
 
357 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  48.23 
 
 
419 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  47.79 
 
 
357 aa  313  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  46.67 
 
 
377 aa  313  7.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  44.8 
 
 
371 aa  312  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  50.15 
 
 
379 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.31 
 
 
371 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.01 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  47.43 
 
 
379 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.53 
 
 
379 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  44.05 
 
 
391 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.68 
 
 
379 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  46.54 
 
 
420 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  48.39 
 
 
379 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.39 
 
 
379 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  43.01 
 
 
369 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  47.52 
 
 
362 aa  303  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  43.01 
 
 
369 aa  302  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  44.93 
 
 
380 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  46.47 
 
 
389 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  46.47 
 
 
372 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  46.47 
 
 
355 aa  300  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.01 
 
 
466 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  46.18 
 
 
419 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  45.53 
 
 
418 aa  294  4e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  45.53 
 
 
418 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  46.54 
 
 
428 aa  291  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  46.01 
 
 
428 aa  290  8e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.35 
 
 
427 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.99 
 
 
418 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  41.26 
 
 
361 aa  283  9e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  42.38 
 
 
423 aa  281  2e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  42.59 
 
 
376 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  45.36 
 
 
424 aa  278  3e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  44.57 
 
 
349 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  44.69 
 
 
419 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  43.06 
 
 
380 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  42.66 
 
 
419 aa  261  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.85 
 
 
425 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  41.03 
 
 
417 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  40.46 
 
 
417 aa  257  4e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  42.02 
 
 
418 aa  257  6e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  41.46 
 
 
422 aa  256  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  38.68 
 
 
423 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.91 
 
 
388 aa  239  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.5 
 
 
391 aa  238  3e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.05 
 
 
387 aa  232  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.82 
 
 
391 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.72 
 
 
373 aa  229  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.12 
 
 
391 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.12 
 
 
391 aa  229  1e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37 
 
 
390 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37 
 
 
390 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37 
 
 
390 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  39.13 
 
 
398 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.73 
 
 
390 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  37.53 
 
 
394 aa  227  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.24 
 
 
391 aa  226  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.37 
 
 
380 aa  224  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.55 
 
 
386 aa  223  7e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  34.2 
 
 
379 aa  223  9.999999999999999e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  38.38 
 
 
396 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  36.47 
 
 
391 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  38.7 
 
 
411 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  44.28 
 
 
316 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  44.28 
 
 
299 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  36.34 
 
 
410 aa  213  7e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  36.13 
 
 
460 aa  212  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.5 
 
 
403 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.5 
 
 
403 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  34.58 
 
 
617 aa  200  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0892  hypothetical protein  43.75 
 
 
288 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.237155 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1036  hypothetical protein  43.75 
 
 
288 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.582749  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  36.31 
 
 
363 aa  187  7e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  36.84 
 
 
446 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 
437 aa  176  9e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.73 
 
 
420 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  35.91 
 
 
448 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.42 
 
 
388 aa  170  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  33.24 
 
 
546 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.77 
 
 
423 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  33.68 
 
 
438 aa  159  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  31.42 
 
 
439 aa  157  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  31.73 
 
 
408 aa  153  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  33.12 
 
 
442 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  33.16 
 
 
416 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  30.86 
 
 
421 aa  145  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  30.5 
 
 
422 aa  144  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>