229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2145 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 423 aa  872    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  57.07 
 
 		 430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  48.53 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  49.24 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  48.15 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.05 
 
 		 601 aa  360  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  45.88 
 
 		 621 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.63 
 
 		 602 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  46.83 
 
 		 587 aa  348  9e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3645  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.63 
 
 		 592 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683493  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0451  L-sorbosone dehydrogenase  44.69 
 
 		 427 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  46.31 
 
 		 587 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  45.77 
 
 		 548 aa  332  6e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1904  L-sorbosone dehydrogenase  42.2 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883513  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1973  L-sorbosone dehydrogenase  41.88 
 
 		 436 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  34.55 
 
 		 363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  33.49 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  34.62 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  33.51 
 
 		 396 aa  183  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.51 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  33.41 
 
 		 448 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  34.16 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  33.76 
 
 		 460 aa  179  7e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  33.33 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  34.63 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  32.9 
 
 		 617 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.58 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  33.09 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  33.09 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  33.09 
 
 		 456 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  34.41 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  33.25 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 		 430 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.92 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  34.02 
 
 		 398 aa  169  9e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  31.88 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.94 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.51 
 
 		 373 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  33.99 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.68 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.68 
 
 		 403 aa  166  9e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.97 
 
 		 361 aa  166  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  32.69 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  32.54 
 
 		 430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.17 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  31.16 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.76 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  32.14 
 
 		 430 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.04 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.88 
 
 		 391 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.42 
 
 		 436 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.65 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  33.01 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  30.64 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  32.07 
 
 		 445 aa  160  4e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  32.46 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.18 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.18 
 
 		 391 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  31.78 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  30.77 
 
 		 446 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  30.15 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  31.39 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  31.81 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  31.46 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.19 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.43 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  31.86 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.44 
 
 		 391 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  31.06 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.43 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  32.61 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  32.29 
 
 		 438 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  31.63 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  33.07 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.5 
 
 		 391 aa  153  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  29.51 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  31.03 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  33.76 
 
 		 394 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  31.73 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.1 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.23 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.9 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.1 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  30.29 
 
 		 514 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.31 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  30.48 
 
 		 440 aa  150  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  30.32 
 
 		 371 aa  149  6e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 		 451 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.3 
 
 		 369 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.92 
 
 		 390 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  29.49 
 
 		 525 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  30.41 
 
 		 473 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  30.32 
 
 		 439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  32.21 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.99 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.91 
 
 		 424 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  31.05 
 
 		 369 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.68 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.65 
 
 		 377 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  29.83 
 
 		 439 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>