193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6140 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 457 aa  944    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  53.38 
 
 		 430 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  48.15 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  50.48 
 
 		 577 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  48.69 
 
 		 601 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  48.09 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0451  L-sorbosone dehydrogenase  50 
 
 		 427 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  48.83 
 
 		 587 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.62 
 
 		 602 aa  362  1e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1904  L-sorbosone dehydrogenase  42.36 
 
 		 437 aa  352  5.9999999999999994e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883513  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.48 
 
 		 587 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1973  L-sorbosone dehydrogenase  45.81 
 
 		 436 aa  347  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  43.85 
 
 		 621 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  40.99 
 
 		 548 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3645  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.45 
 
 		 592 aa  335  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683493  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  29.48 
 
 		 396 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  31.7 
 
 		 446 aa  163  6e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  28.64 
 
 		 363 aa  162  9e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  29.98 
 
 		 410 aa  159  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  29.06 
 
 		 617 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  26.63 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  29.94 
 
 		 438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.44 
 
 		 436 aa  153  5.9999999999999996e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  29.12 
 
 		 448 aa  152  8.999999999999999e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.23 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  29.18 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  30.39 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  29.98 
 
 		 394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  29.02 
 
 		 411 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  29.8 
 
 		 381 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.95 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.04 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  26.26 
 
 		 398 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.08 
 
 		 419 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  27.98 
 
 		 384 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.47 
 
 		 391 aa  144  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.31 
 
 		 379 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.22 
 
 		 373 aa  143  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.48 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.61 
 
 		 380 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.6 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.73 
 
 		 369 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  31.44 
 
 		 446 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  27.09 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  27.09 
 
 		 372 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  27.09 
 
 		 355 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.42 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.79 
 
 		 371 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.6 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.96 
 
 		 420 aa  136  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.97 
 
 		 388 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  28.47 
 
 		 363 aa  136  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.12 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.62 
 
 		 386 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.55 
 
 		 367 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.29 
 
 		 380 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.06 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.81 
 
 		 391 aa  134  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.72 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.37 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.25 
 
 		 388 aa  134  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  29.78 
 
 		 422 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 439 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.42 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.42 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  28.47 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.23 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  28.54 
 
 		 439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  26.65 
 
 		 357 aa  131  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.97 
 
 		 390 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.98 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  27.72 
 
 		 363 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.97 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.97 
 
 		 390 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.05 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.05 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  27.63 
 
 		 379 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.72 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  25.23 
 
 		 394 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  27.07 
 
 		 642 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.38 
 
 		 379 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  28.97 
 
 		 448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.41 
 
 		 379 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  26.71 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  26.67 
 
 		 379 aa  127  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  29.64 
 
 		 438 aa  126  7e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  27.6 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.6 
 
 		 379 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  28.48 
 
 		 438 aa  126  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  27.65 
 
 		 349 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  28.69 
 
 		 448 aa  125  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  25.86 
 
 		 357 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.12 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  28.14 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  28.42 
 
 		 430 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  27.71 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  28.69 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.32 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  29.09 
 
 		 440 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>