274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3645 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3645  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
592 aa  1179    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683493  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  61.04 
 
 
621 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  77.17 
 
 
602 aa  910    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  68.98 
 
 
587 aa  749    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  47.58 
 
 
430 aa  352  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  45.76 
 
 
423 aa  346  7e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  42.45 
 
 
457 aa  337  5e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  43.87 
 
 
434 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  35.29 
 
 
577 aa  323  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.95 
 
 
601 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0451  L-sorbosone dehydrogenase  37.64 
 
 
427 aa  278  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  38.81 
 
 
548 aa  269  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  33.87 
 
 
587 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1904  L-sorbosone dehydrogenase  38.28 
 
 
437 aa  261  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883513  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1973  L-sorbosone dehydrogenase  39.66 
 
 
436 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208265  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  35.98 
 
 
363 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  34.83 
 
 
460 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  31.04 
 
 
418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.96 
 
 
403 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.96 
 
 
403 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  32.1 
 
 
437 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.86 
 
 
371 aa  135  3e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  31.82 
 
 
410 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  30.79 
 
 
448 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  31.11 
 
 
446 aa  130  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  29.57 
 
 
448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  31.03 
 
 
446 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  30.64 
 
 
423 aa  128  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  27.18 
 
 
446 aa  127  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.05 
 
 
388 aa  126  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.95 
 
 
436 aa  126  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.71 
 
 
386 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.38 
 
 
361 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.57 
 
 
373 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  30.36 
 
 
617 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  28.81 
 
 
448 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.33 
 
 
424 aa  125  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  31.53 
 
 
396 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.81 
 
 
456 aa  124  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.88 
 
 
419 aa  123  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
411 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  28.57 
 
 
384 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.59 
 
 
371 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  29.36 
 
 
438 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.71 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.71 
 
 
390 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.19 
 
 
369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 
389 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  30.88 
 
 
372 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  29.95 
 
 
501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.38 
 
 
371 aa  120  6e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  30.56 
 
 
447 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.33 
 
 
387 aa  120  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  27.08 
 
 
394 aa  120  9e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  31.21 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  27.86 
 
 
363 aa  119  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.16 
 
 
362 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  30.64 
 
 
355 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.48 
 
 
390 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.42 
 
 
369 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.93 
 
 
380 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.02 
 
 
390 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  27.94 
 
 
447 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  29.31 
 
 
430 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 
461 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.29 
 
 
420 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.59 
 
 
361 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  29.59 
 
 
435 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  30.99 
 
 
446 aa  117  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  29.29 
 
 
438 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.52 
 
 
391 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  29.15 
 
 
430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  26.97 
 
 
473 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  28.68 
 
 
448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  30.62 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  29.76 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  27.57 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.76 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.54 
 
 
423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  29.4 
 
 
446 aa  115  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  28.7 
 
 
447 aa  115  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  30.14 
 
 
444 aa  115  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.8 
 
 
379 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.18 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.97 
 
 
367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  27.86 
 
 
381 aa  114  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  27.86 
 
 
363 aa  114  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  30.02 
 
 
445 aa  114  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.65 
 
 
391 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.76 
 
 
379 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  28.27 
 
 
430 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.72 
 
 
391 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.54 
 
 
433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  29.79 
 
 
514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.8 
 
 
391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  28 
 
 
525 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.4 
 
 
466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  29.93 
 
 
438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  30.26 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.6 
 
 
379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>