278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3274 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_3645  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  81.37 
 
 
592 aa  907    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.683493  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  60.57 
 
 
621 aa  691    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  69.02 
 
 
587 aa  787    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3274  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  100 
 
 
602 aa  1219    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603127  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  48.43 
 
 
430 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  45.31 
 
 
457 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  44.63 
 
 
423 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  44.42 
 
 
434 aa  348  1e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2442  NHL repeat containing protein  35.06 
 
 
577 aa  327  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0106112  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3966  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.5 
 
 
601 aa  327  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0451  L-sorbosone dehydrogenase  40.59 
 
 
427 aa  286  9e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3348  cytochrome c class I  35.53 
 
 
587 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123322  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0027  cytochrome c class I  39.62 
 
 
548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.16509  normal  0.0410464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1973  L-sorbosone dehydrogenase  41.13 
 
 
436 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208265  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1904  L-sorbosone dehydrogenase  38.05 
 
 
437 aa  267  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883513  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  33.42 
 
 
363 aa  164  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  30.37 
 
 
418 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  30.91 
 
 
460 aa  143  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  30.32 
 
 
446 aa  143  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.57 
 
 
371 aa  136  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.69 
 
 
403 aa  134  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.69 
 
 
403 aa  134  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  29.34 
 
 
437 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.47 
 
 
436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  31.57 
 
 
424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.43 
 
 
371 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  29.32 
 
 
384 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  30.62 
 
 
410 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  29.48 
 
 
448 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.41 
 
 
387 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.03 
 
 
380 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  29.46 
 
 
435 aa  127  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  29.76 
 
 
438 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.82 
 
 
388 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  29.53 
 
 
361 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.57 
 
 
373 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.29 
 
 
369 aa  126  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.32 
 
 
386 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  29.75 
 
 
448 aa  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.28 
 
 
420 aa  125  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  30.03 
 
 
448 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  28.19 
 
 
381 aa  124  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  27.83 
 
 
430 aa  123  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  29.02 
 
 
446 aa  123  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  27.73 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  29.1 
 
 
448 aa  123  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  29.92 
 
 
446 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  29.27 
 
 
423 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.54 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  30.96 
 
 
394 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  27.86 
 
 
363 aa  122  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  27.67 
 
 
411 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  27.54 
 
 
371 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  30.73 
 
 
442 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  30 
 
 
617 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.83 
 
 
391 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  29.68 
 
 
501 aa  120  7.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.78 
 
 
379 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  31.53 
 
 
396 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.08 
 
 
433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.1 
 
 
391 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  27.38 
 
 
525 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.15 
 
 
391 aa  118  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  28.1 
 
 
430 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.72 
 
 
390 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.72 
 
 
390 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.11 
 
 
391 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  26.92 
 
 
456 aa  117  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  28.61 
 
 
444 aa  117  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.34 
 
 
391 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.34 
 
 
391 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.79 
 
 
391 aa  117  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  28.21 
 
 
446 aa  116  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  26.62 
 
 
442 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.05 
 
 
361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  31.02 
 
 
461 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.85 
 
 
380 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  29.8 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  29.14 
 
 
379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.8 
 
 
390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.49 
 
 
367 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  27.46 
 
 
430 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.8 
 
 
390 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  28.06 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  27.91 
 
 
430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  26.11 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.05 
 
 
419 aa  114  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  27.03 
 
 
423 aa  114  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  28.4 
 
 
417 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  28.81 
 
 
349 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  26.87 
 
 
363 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.89 
 
 
379 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  27.4 
 
 
447 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  27.53 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  27.53 
 
 
430 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  27.12 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  27.43 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  27.68 
 
 
447 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  27.55 
 
 
438 aa  112  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  28.9 
 
 
514 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>