256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2978 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  100 
 
 		 394 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  90.61 
 
 		 394 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  71.1 
 
 		 379 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  69.39 
 
 		 419 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  69.1 
 
 		 389 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  69.1 
 
 		 372 aa  518  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  69.1 
 
 		 355 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  66.84 
 
 		 379 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  69.77 
 
 		 379 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  69.94 
 
 		 379 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  69.94 
 
 		 379 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  66.76 
 
 		 379 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  65.18 
 
 		 379 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  68.68 
 
 		 357 aa  491  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  67.05 
 
 		 357 aa  486  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  61.13 
 
 		 391 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  64.53 
 
 		 377 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  57.34 
 
 		 384 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  58.19 
 
 		 436 aa  413  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  58.73 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  68.38 
 
 		 299 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  68.38 
 
 		 316 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  57.89 
 
 		 381 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  54.95 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  57.06 
 
 		 379 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  56.02 
 
 		 371 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  55.28 
 
 		 363 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  54.17 
 
 		 363 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  53.28 
 
 		 361 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54.62 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  56.82 
 
 		 376 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  50 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  51.73 
 
 		 349 aa  350  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  51.23 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.96 
 
 		 369 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  46.58 
 
 		 371 aa  344  2e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.14 
 
 		 369 aa  340  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  48.27 
 
 		 417 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  47.98 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  47.85 
 
 		 380 aa  333  4e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  46.82 
 
 		 361 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  47.95 
 
 		 642 aa  326  3e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  46.33 
 
 		 425 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  47.56 
 
 		 380 aa  315  7e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.3 
 
 		 419 aa  280  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  41.11 
 
 		 394 aa  273  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  41.78 
 
 		 388 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  39.85 
 
 		 418 aa  267  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  43.42 
 
 		 420 aa  260  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  37.88 
 
 		 423 aa  259  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  41.76 
 
 		 387 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.29 
 
 		 380 aa  259  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.52 
 
 		 386 aa  256  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  40.88 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.67 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.67 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.67 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.39 
 
 		 390 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.53 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.89 
 
 		 391 aa  250  4e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.64 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.29 
 
 		 391 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.53 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  39.53 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  40.95 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.95 
 
 		 428 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.95 
 
 		 428 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.33 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.23 
 
 		 418 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  39.83 
 
 		 427 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.11 
 
 		 418 aa  233  3e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  37.75 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  40.11 
 
 		 418 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  36.89 
 
 		 419 aa  230  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  38.69 
 
 		 419 aa  229  7e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  39.31 
 
 		 363 aa  228  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  33.95 
 
 		 379 aa  220  3e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  36.98 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.5 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.5 
 
 		 403 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  34.58 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  33.15 
 
 		 411 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  33.5 
 
 		 617 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  33.88 
 
 		 410 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  32.29 
 
 		 546 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.58 
 
 		 420 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.88 
 
 		 437 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  32.63 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.48 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  32.71 
 
 		 408 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  35.55 
 
 		 438 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  30.29 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  33.67 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  31.55 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.03 
 
 		 448 aa  156  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  33.07 
 
 		 423 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  32.67 
 
 		 439 aa  152  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  30.63 
 
 		 430 aa  149  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  31.97 
 
 		 430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6140  L-sorbosone dehydrogenase  30.39 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.867476  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>