259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1623 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1623  L-sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 420 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  70 
 
 		 419 aa  593  1e-168  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  64.98 
 
 		 428 aa  535  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  65.58 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  61.3 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2740  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  58.44 
 
 		 418 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.120744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1399  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  58.68 
 
 		 418 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1771  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  58.68 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.230445 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  57.97 
 
 		 422 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1588  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  60 
 
 		 419 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  59 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2082  putative sorbosone/glucose dehydrogenase  53.32 
 
 		 419 aa  442  1e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  46.54 
 
 		 642 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  44.29 
 
 		 379 aa  273  6e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45 
 
 		 371 aa  273  6e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  40.76 
 
 		 394 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  43.42 
 
 		 394 aa  262  8e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  44.35 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.29 
 
 		 379 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  41.44 
 
 		 371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  42.31 
 
 		 384 aa  249  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  42.3 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.3 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.58 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  42.22 
 
 		 379 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.5 
 
 		 436 aa  242  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  41.6 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.23 
 
 		 379 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  42.3 
 
 		 379 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  40.11 
 
 		 363 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  38.95 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  40.55 
 
 		 363 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  41.26 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  40.28 
 
 		 377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  38.94 
 
 		 389 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  38.94 
 
 		 372 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  39.06 
 
 		 357 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  38.94 
 
 		 355 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  40.93 
 
 		 357 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.83 
 
 		 419 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  39.12 
 
 		 391 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  38.87 
 
 		 369 aa  227  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.63 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  40.72 
 
 		 349 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  33.63 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  38.71 
 
 		 380 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  38.61 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  38.93 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  35.62 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  36.15 
 
 		 425 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  38.57 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  36.19 
 
 		 418 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  38.89 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.88 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1425  putative L-sorbosone dehydrogenase  34.52 
 
 		 376 aa  194  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.45 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  28.76 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  33.17 
 
 		 437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  30.19 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  32.97 
 
 		 446 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.59 
 
 		 373 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  35.42 
 
 		 299 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  35.42 
 
 		 316 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.3 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  33.79 
 
 		 396 aa  153  7e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.3 
 
 		 390 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.28 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.3 
 
 		 390 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.3 
 
 		 390 aa  152  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.92 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  30.14 
 
 		 460 aa  150  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  28.95 
 
 		 411 aa  149  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.04 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.05 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.35 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.35 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.92 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.92 
 
 		 391 aa  149  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.03 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.02 
 
 		 380 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  30.47 
 
 		 546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  33.7 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 423 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  32.98 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.12 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.92 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  29.13 
 
 		 617 aa  139  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.27 
 
 		 420 aa  139  8.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  31.38 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  36.67 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  30.8 
 
 		 439 aa  136  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  29.49 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  37.17 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  31.97 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  33.47 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  30.59 
 
 		 410 aa  129  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  32.75 
 
 		 447 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  30.65 
 
 		 448 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  30.18 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  32.4 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>