261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2640 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  100 
 
 
451 aa  906    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  65.75 
 
 
448 aa  566  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  65.98 
 
 
448 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  64.98 
 
 
448 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  63.66 
 
 
442 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  63.43 
 
 
442 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  63.79 
 
 
438 aa  533  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  61.89 
 
 
435 aa  532  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  61.72 
 
 
437 aa  531  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  61.06 
 
 
446 aa  518  1e-146  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  61.81 
 
 
440 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  59.06 
 
 
456 aa  509  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  58.85 
 
 
444 aa  510  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  61.39 
 
 
446 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  60.4 
 
 
447 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  59.1 
 
 
447 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  56.42 
 
 
454 aa  506  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  60.19 
 
 
448 aa  504  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  63.05 
 
 
438 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  61.03 
 
 
447 aa  499  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  59 
 
 
452 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  57.83 
 
 
442 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  58.18 
 
 
446 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  58.84 
 
 
445 aa  484  1e-135  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  57.87 
 
 
454 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  56.31 
 
 
461 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  55.35 
 
 
465 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  54.67 
 
 
439 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  54.5 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  54.04 
 
 
446 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  55.61 
 
 
485 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  55.61 
 
 
485 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  54.1 
 
 
436 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  51.27 
 
 
436 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.26 
 
 
448 aa  426  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  49.22 
 
 
525 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  50.34 
 
 
514 aa  418  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.21 
 
 
457 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  53.55 
 
 
438 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  48.97 
 
 
439 aa  411  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  51.76 
 
 
430 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  51.76 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  50.46 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  51.62 
 
 
430 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  50.82 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  51.98 
 
 
429 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  51.37 
 
 
430 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  51.49 
 
 
429 aa  395  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  51.75 
 
 
433 aa  396  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  51.62 
 
 
430 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  50.99 
 
 
434 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  47.36 
 
 
433 aa  393  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  51.49 
 
 
429 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  45.95 
 
 
438 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  45.64 
 
 
420 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  47.49 
 
 
501 aa  379  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  45.62 
 
 
422 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  43.78 
 
 
423 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  49.14 
 
 
473 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  45.63 
 
 
447 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  44.62 
 
 
421 aa  359  5e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  37.74 
 
 
448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  37.43 
 
 
446 aa  263  6e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  38.16 
 
 
546 aa  256  5e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  38.33 
 
 
437 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  37.17 
 
 
363 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  32.42 
 
 
460 aa  189  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  32.24 
 
 
398 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  31.84 
 
 
418 aa  179  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  35.31 
 
 
361 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.81 
 
 
367 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  32.88 
 
 
396 aa  163  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  31.81 
 
 
617 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.69 
 
 
379 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  31.45 
 
 
381 aa  158  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.23 
 
 
361 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  33.85 
 
 
349 aa  153  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  33.54 
 
 
384 aa  152  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2505  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  33.75 
 
 
369 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.867319  normal  0.0176215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.54 
 
 
371 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2597  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  33.75 
 
 
380 aa  150  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.733304  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.78 
 
 
436 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  29.78 
 
 
423 aa  149  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  34.16 
 
 
371 aa  149  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2435  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  33.64 
 
 
369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.216598  hitchhiker  0.00191889 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.63 
 
 
371 aa  144  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.79 
 
 
380 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  28.07 
 
 
411 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0697  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  34.27 
 
 
443 aa  140  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.33 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.79 
 
 
391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.33 
 
 
390 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0146  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  33.14 
 
 
438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.699108  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.68 
 
 
357 aa  136  8e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.61 
 
 
424 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  34.36 
 
 
362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  33.03 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.67 
 
 
403 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.67 
 
 
403 aa  134  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.72 
 
 
390 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>