266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0428 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1781  putative membrane-anchored oxidoreductase, L-sorbosone dehydrogenase  99.18 
 
 		 485 aa  957    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.368311  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  70.29 
 
 		 525 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  73.48 
 
 		 514 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0428  putative membrane-anchored oxidoreductase  100 
 
 		 485 aa  968    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  58.94 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0395  L-sorbosone dehydrogenase  60.05 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4899  L-sorbosone dehydrogenase  57.84 
 
 		 447 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0732  L-sorbosone dehydrogenase  56.8 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3024  L-sorbosone dehydrogenase  57.11 
 
 		 448 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1639  L-sorbosone dehydrogenase  54.65 
 
 		 437 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0225177 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1979  NHL repeat-containing protein  57.11 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.902626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2920  L-sorbosone dehydrogenase  54.93 
 
 		 448 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00641513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2796  L-sorbosone dehydrogenase  56.39 
 
 		 448 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1707  L-sorbosone dehydrogenase  52.37 
 
 		 442 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3682  L-sorbosone dehydrogenase  52.14 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548979  hitchhiker  0.00612672 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3494  L-sorbosone dehydrogenase  55.83 
 
 		 446 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0961281  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2067  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  51.76 
 
 		 456 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0795  L-sorbosone dehydrogenase  55.84 
 
 		 447 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47060  L-sorbosone dehydrogenase  56.49 
 
 		 440 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0906  L-sorbosone dehydrogenase  53.35 
 
 		 447 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  55.53 
 
 		 446 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1723  L-sorbosone dehydrogenase  52.89 
 
 		 435 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000227847 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2420  L-sorbosone dehydrogenase  56.14 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.840322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2727  L-sorbosone dehydrogenase  54.59 
 
 		 438 aa  444  1e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0781  L-sorbosone dehydrogenase  50.99 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1806  L-sorbosone dehydrogenase  51.03 
 
 		 465 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.780322  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  54.44 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2640  putative L-sorbosone dehydrogenase  55.84 
 
 		 451 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.532913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  53.75 
 
 		 442 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  54.44 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1270  L-sorbosone dehydrogenase  52.05 
 
 		 454 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.315721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03080  L-sorbosone dehydrogenase  51.74 
 
 		 445 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3687  L-sorbosone dehydrogenase  52.57 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2827  L-sorbosone dehydrogenase  53.69 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1787  L-sorbosone dehydrogenase  52.57 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409847  hitchhiker  0.00688825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  52.51 
 
 		 439 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  51.12 
 
 		 448 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2302  L-sorbosone dehydrogenase  55.2 
 
 		 430 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  0.586035 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  53.33 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0737  L-sorbosone dehydrogenase  50.49 
 
 		 454 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.684537  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2746  L-sorbosone dehydrogenase  51.75 
 
 		 438 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.298612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  51.86 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1954  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  54.28 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.051744  normal  0.930845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2392  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  52.53 
 
 		 448 aa  404  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  45.74 
 
 		 438 aa  389  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  48.76 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  47.04 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.08 
 
 		 420 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6326  putative L-sorbosone dehydrogenase  49.14 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0129  L-sorbosone dehydrogenase  46.17 
 
 		 501 aa  353  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0709  L-sorbosone dehydrogenase  44.87 
 
 		 447 aa  353  4e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.570753 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2734  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  47.03 
 
 		 457 aa  352  7e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0228089  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.51 
 
 		 423 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  42.33 
 
 		 422 aa  349  6e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2479  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  49.03 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000414902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0504  L-sorbosone dehydrogenase  45.5 
 
 		 434 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  46.23 
 
 		 429 aa  341  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3908  hypothetical protein  45.76 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.724834  normal  0.185081 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3072  putative L-sorbosone dehydrogenase  45.65 
 
 		 429 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.726244  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  42.75 
 
 		 421 aa  331  2e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3799  putative L-sorbosone dehydrogenase  45.41 
 
 		 429 aa  329  7e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.410038  normal  0.17604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  39.43 
 
 		 448 aa  272  1e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  36.96 
 
 		 446 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  37.14 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  36.98 
 
 		 546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  34.82 
 
 		 363 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  34.74 
 
 		 460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  34.13 
 
 		 398 aa  193  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  34.22 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  32.89 
 
 		 418 aa  186  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.25 
 
 		 367 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  30.54 
 
 		 617 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32.01 
 
 		 361 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  31.94 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  32 
 
 		 379 aa  159  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.97 
 
 		 436 aa  159  8e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  30.93 
 
 		 381 aa  156  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  29.32 
 
 		 411 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.81 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.06 
 
 		 391 aa  153  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.79 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  37.23 
 
 		 362 aa  149  9e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0900  putative L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  32.9 
 
 		 361 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.54 
 
 		 380 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  32.55 
 
 		 371 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  29.68 
 
 		 423 aa  145  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.6 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.6 
 
 		 403 aa  145  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  29.35 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  34.15 
 
 		 357 aa  143  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.88 
 
 		 373 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  34.65 
 
 		 466 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.9 
 
 		 391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.34 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.44 
 
 		 391 aa  141  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.58 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  31.58 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  34.9 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.45 
 
 		 377 aa  140  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.7 
 
 		 391 aa  140  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>