More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0421 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  100 
 
 		 363 aa  738    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0624  L-sorbosone dehydrogenase  34.53 
 
 		 460 aa  179  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0627  glucose sorbosone dehydrogenase  30.52 
 
 		 411 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.308519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5288  PEBP family protein  31.94 
 
 		 617 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  33.24 
 
 		 363 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2541  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  33.24 
 
 		 391 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4522  glucose sorbosone dehydrogenase  31.69 
 
 		 423 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3122  L-sorbosone dehydrogenase  30.97 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  31.2 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3015  oxidoreductase, putative  31.58 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.754871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2684  hypothetical protein  29.12 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2488  glucose sorbosone dehydrogenase  29.97 
 
 		 410 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583653  normal  0.172855 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.71 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.71 
 
 		 403 aa  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0932  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.86 
 
 		 357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0678662 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2815  hypothetical protein  29.76 
 
 		 363 aa  135  8e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0874  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.97 
 
 		 357 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2003  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.18 
 
 		 436 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.528812 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2978  putative membrane-bound dehydrogenase  30.88 
 
 		 394 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0356498 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0783  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.62 
 
 		 466 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.194417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.59 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5447  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.48 
 
 		 424 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1027  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.69 
 
 		 379 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2771  L-sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.069543  normal  0.0541194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  31.1 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0589  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  31.69 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1068  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.69 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1005  putative membrane-bound dehydrogenase  30.56 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0948  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  31.05 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.168955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0944  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  31.38 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1406  L-sorbosone dehydrogenase  29.63 
 
 		 448 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.685553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1108  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  30.03 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  29.12 
 
 		 466 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  31.09 
 
 		 355 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  31.09 
 
 		 372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  31.09 
 
 		 389 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2788  NHL repeat-containing protein  28.29 
 
 		 349 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1726  L-sorbosone dehydrogenase, putative  29.75 
 
 		 362 aa  126  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1469  NHL repeat containing protein  30.77 
 
 		 439 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3234  NHL repeat containing protein  28.49 
 
 		 446 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  30.88 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.17 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1944  L-sorbosone dehydrogenase  28.84 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.358319  normal  0.0404039 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0415  NHL repeat-containing protein  28.98 
 
 		 416 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.96309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  29.94 
 
 		 377 aa  123  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0422  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.14 
 
 		 423 aa  119  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  34.93 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  29.36 
 
 		 384 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3490  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.28 
 
 		 371 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  27.6 
 
 		 546 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2748  putative L-sorbosone dehydrogenase  28.14 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.970962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0508  L-sorbosone dehydrogenase (SNDH)  28.11 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0193  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.53 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0809  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  27.17 
 
 		 417 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0941  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.41 
 
 		 361 aa  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0785845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2660  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  26.88 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3898  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.98 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0619  putative L-sorbosone dehydrogenase  26.05 
 
 		 417 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0024  hypothetical protein  23.15 
 
 		 379 aa  110  3e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3094  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  36.45 
 
 		 427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.379716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  28.61 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0148  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.69 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.392107 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0780  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.75 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.695554  hitchhiker  0.00000105496 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1065  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  28.19 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0311  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  26.69 
 
 		 425 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.229371  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3042  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.75 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  31.39 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1682  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  35.27 
 
 		 428 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.334318 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  31.39 
 
 		 299 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3326  glucose sorbosone dehydrogenase  28.44 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  28.24 
 
 		 642 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3230  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.51 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.400562  hitchhiker  0.00000328613 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0759  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.51 
 
 		 391 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.608473  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4189  L-sorbosone dehydrogenase, putative  27.51 
 
 		 373 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0787  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.33 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.187468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0812  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.33 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  unclonable  0.00000000000358198 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4119  L-sorbosone dehydrogenase  29.76 
 
 		 448 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0257  putative glucose/sorbosone dehydrogenase; putative peptide signal  28.06 
 
 		 446 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3631  L-sorbosone dehydrogenase  27.94 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000516616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0496  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  34.05 
 
 		 428 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0409715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3572  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.33 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.255518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0819  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.33 
 
 		 390 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.450693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3219  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.21 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00839547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5064  NHL repeat-containing protein  32.38 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409782  hitchhiker  0.00484678 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3557  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.3 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.683195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1425  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 		 446 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2145  L-sorbosone dehydrogenase  26.72 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0287  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  29.91 
 
 		 419 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.473358 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3787  L-sorbosone dehydrogenase  29.82 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.510654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3378  putative glucose/sorbosone dehydrogenase  32.3 
 
 		 422 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0511  L-sorbosone dehydrogenase  29.89 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3647  L-sorbosone dehydrogenase  27.37 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000551723  normal  0.19553 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0550  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.87 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.123721 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0731  L-sorbosone dehydrogenase, putative  26.92 
 
 		 391 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000431529 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10028  L-sorbosone dehydrogenase  30.47 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0774  L-sorbosone dehydrogenase, putative  25.44 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0250675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0907  cytochrome c class I  26.46 
 
 		 621 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.433634 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1756  L-sorbosone dehydrogenase  25.96 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.78127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3110  L-sorbosone dehydrogenase  28.52 
 
 		 430 aa  99.4  9e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3613  L-sorbosone dehydrogenase  28.52 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>